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Gene

SUPT16H

SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit

Sintesi

Localizzazione citogenetica
14q11.2
Coordinate
Cromosoma 14: 21.351.476–21.384.019 (GRCh38)
Esoni
26 esoni su 32,5 kb
Proteina
1047 amminoacidi
Noto anche come
FACT, FACTP140, SPT16/CDC68, FLJ14010, FLJ10857, CDC68
Trascritto MANE Select
ENST00000216297.7NM_007192.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SUPT16H. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SUPT16H

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 14, con una parentesi dove si trova SUPT16H. SUPT16H e 24 geni nelle vicinanze sul cromosoma 14, da 20.867.748 a 21.867.747.Cromosoma 1414q11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3321 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 Mb21,8 MbRNASE3: 20.882.394–20.892.348, filamento direttoRNASE3RNASE2: 20.955.345–20.956.436, filamento direttoRNASE2METTL17: 20.989.775–20.997.035, filamento direttoSLC39A2: 20.999.255–21.001.871, filamento direttoNDRG2: 21.016.584–21.071.094, filamento inversoTPPP2: 21.024.086–21.036.276, filamento direttoTPPP2RNASE13: 21.032.818–21.034.807, filamento inversoRNASE7: 21.042.316–21.044.234, filamento direttoRNASE8: 21.057.822–21.058.455, filamento direttoRNASE8ARHGEF40: 21.069.626–21.090.269, filamento direttoARHGEF40ZNF219: 21.089.468–21.104.722, filamento inversoZNF219TMEM253: 21.098.811–21.103.724, filamento direttoTMEM253OR5AU1: 21.148.370–21.159.060, filamento inversoOR5AU1HNRNPC: 21.207.375–21.269.792, filamento inversoHNRNPCRPGRIP1: 21.280.083–21.351.301, filamento direttoRPGRIP1SUPT16H: 21.351.476–21.384.019, filamento inversoSUPT16HCHD8: 21.385.194–21.456.126, filamento inversoCHD8RAB2B: 21.458.704–21.476.973, filamento inversoRAB2BTOX4: 21.476.597–21.504.234, filamento direttoTOX4METTL3: 21.498.127–21.511.430, filamento inversoMETTL3SALL2: 21.521.080–21.537.230, filamento inversoSALL2OR10G3: 21.568.520–21.580.076, filamento inversoOR10G3OR10G2: 21.633.836–21.634.940, filamento inversoOR10G2OR4E2: 21.653.835–21.667.642, filamento direttoOR4E2OR4E1: 21.667.886–21.673.818, filamento inversoOR4E1Diagramma di SUPT16H: 26 esoni sul filamento inverso del cromosoma 14Esone 22: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 19: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 18: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 13: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 10: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 26: 21.351.476–21.352.818, 1343 basiEsone 25: 21.353.488–21.353.565, 78 basiEsone 24: 21.353.703–21.353.832, 130 basiEsone 23: 21.354.411–21.354.540, 130 basiEsone 22: 21.357.197–21.357.366, 170 basiEsone 21: 21.357.927–21.358.002, 76 basiEsone 20: 21.358.315–21.358.427, 113 basiEsone 19: 21.359.484–21.359.609, 126 basiEsone 18: 21.360.415–21.360.533, 119 basiEsone 17: 21.360.846–21.360.972, 127 basiEsone 16: 21.361.078–21.361.213, 136 basiEsone 15: 21.362.197–21.362.324, 128 basiEsone 14: 21.362.794–21.362.947, 154 basiEsone 13: 21.363.034–21.363.149, 116 basiEsone 12: 21.363.233–21.363.328, 96 basiEsone 11: 21.363.438–21.363.503, 66 basiEsone 10: 21.364.827–21.364.939, 113 basiEsone 9: 21.365.070–21.365.143, 74 basiEsone 8: 21.366.439–21.366.529, 91 basiEsone 7: 21.368.269–21.368.441, 173 basiEsone 6: 21.369.204–21.369.355, 152 basiEsone 5: 21.369.750–21.369.896, 147 basiEsone 4: 21.370.336–21.370.488, 153 basiEsone 3: 21.371.874–21.372.044, 171 basiEsone 2: 21.373.338–21.373.430, 93 basiEsone 1: 21.383.862–21.384.019, 158 basi2625201510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,4 kb dei 32,5 kb del gene; 3144 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge SUPT16H

5

posizioni in SUPT16H in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 32,5 kb di SUPT16H, introni inclusi, non solo i 4,4 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SUPT16H: SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/supt16h

Vancouver

Dante Labs. Gene SUPT16H: SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/supt16h

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