Gén
PIGL
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class L
- HGNC 8966↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000108474↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 9487↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 17p11.2
- Koordináták
- 17. kromoszóma: 16 217 210–16 326 411 (GRCh38)
- Exonok
- 7 exon, összesen 109,2 kb
- Fehérje
- 252 aminosav
- Más néven ismert
- PIG-L
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000225609.10NM_004278.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pigl.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PIGL-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
GPI Anchor Biosynthesis Defects
- Disorders of GPI Anchor Biosynthesis
A group of inherited conditions caused by variants in the PIG, PGAP and related genes needed to make and attach the GPI anchor, typically causing developmental delay, low muscle tone and epilepsy.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
A 98 hozzá kapcsolódó gén egyike
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Intellectual Disability
A 233 hozzá kapcsolódó gén egyike
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A PIGL felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 109,2 kb-jából 1,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 759 bázis kódolja a fehérjét.
PIGL szekvenálása
8
a PIGL génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a PIGL mind a 109,2 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 1,3 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (8)
The PIGL variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 2
- Valószínűleg patogén 6
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_004278.4(PIGL):c.500T>C (p.Leu167Pro) (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004278.4(PIGL):c.427-1G>A (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.154_161del (p.Asp52fs) (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.236-4664_335+2566del (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.262C>T (p.Arg88Cys) (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.483T>G (p.Tyr161Ter) (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.494+1G>A (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_004278.4(PIGL):c.660+1G>T (opens in a new tab) | CHIME syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)3 betegséget oszt meg
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 22 betegséget oszt meg
- MAN1B1mannosidase alpha class 1B member 12 betegséget oszt meg
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit2 betegséget oszt meg
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 22 betegséget oszt meg
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 32 betegséget oszt meg
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A2 betegséget oszt meg
- PIGCphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class C2 betegséget oszt meg
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N2 betegséget oszt meg
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class O2 betegséget oszt meg
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T2 betegséget oszt meg
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V2 betegséget oszt meg
A(z) PIGL génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PIGL gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Broad head shape
- Wide nasal bridge
- Abnormal dentition
- Abnormality of dental shape
- Decreased size of tooth
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Failure of development of between one and six teeth
Még 39 tulajdonság megjelenítése
- Flat nose
- Full lips
- Short philtrum
- Abnormal facial shape
- Broad opening between the eyelids
- Cleft lower lip
- Cleft palate
- Coarse facial features
- Corners of eye widely separated
- Delayed eruption of teeth
- Downturned corners of mouth
- Drooling
- Drooping lower lip
- Extra teeth
- Highly arched eyebrow
- Limited hair on end of eyebrow
- Open mouth
- Prominent forehead
- Tented mouth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Widely spaced teeth
- Abnormal parietal bone morphology
- Asymmetry of the posterior head
- Bifid uvula
- Big lower jaw
- Broad philtrum
- Bulbous nose
- Cleft lip
- Decreased head circumference
- High palate
- Increased head circumference
- Little lower jaw
- Prominent nasal bridge
- Round face
- Short neck
- Frontal bossing
- Full lower lip
- Webbed neck
- Wide mouth
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Global developmental delay
- Degeneration of cerebrum
- Grand mal seizures
- Inability to coordinate movements when walking
- Myoclonic seizure
- Reduced cerebral white matter volume
Még 15 tulajdonság megjelenítése
- Thin corpus callosum
- Abnormal gait
- Ataxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Cerebral hypomyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Diminished deep tendon reflex
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Jerking
- Violent behavior
- Wide based walk
Abnormality of the eye
- Hole in the back of the eye
- Cross-eyed
- Drooping upper eyelid
- Wide-set eyes
- Corneal opacity
- Horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- Redness of skin or mucous membrane
- Pulmonary valve atresia
- Tetralogy of Fallot
- Transposition of the great arteries
- Double outlet right ventricle
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Narrowing of blood vessel below aortic heart valve
- Narrowing of lung artery
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the musculoskeletal system
- Decreased muscle tone in infant
- Abnormal shape of end part of bone
- Absent collarbone
- Funnel chest
- Abnormal formation of the hip
- Breakdown of bone
- Scoliosis
- Low muscle tone
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PIGL gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class L. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pigl
Dante Labs. PIGL gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class L [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pigl
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt