Geeni
CSPP1
centrosome and spindle pole associated protein 1
- HGNC 26193↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000104218↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 79848↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 8q13.1-q13.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 8: 67 064 392–67 196 614 (GRCh38)
- Eksonit
- 31 eksonia 132,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 226 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ22490, CSPP, JBTS21, CSPP-L
- MANE Select -transkripti
- ENST00000678616.1NM_001382391.1
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CSPP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Joubertin oireyhtymä ja siihen liittyvät häiriöt
- Autosomaalinen resessiivinen
Joubertin oireyhtymä (JS) ja siihen liittyvät häiriöt (JSRD) ovat ryhmä kehityksen viivästymää ja useita synnynnäisiä poikkeavuuksia aiheuttavia oireyhtymiä. Niissä pakollisena piirteenä on "molaarihammasmerkki" (MTS), monimutkainen keskiaivojen ja takaaivojen epämuodostuma, joka voidaan tunnistaa aivojen kuvantamisessa. MTS:lle ovat ominaisia pikkuaivomadon hypoplasia, ylempien pikkuaivovarsien paksuuntuminen ja väärä suuntautuminen sekä poikkeavan syvä interpeduncular-kuoppa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Joubertin oireyhtymä
Ciliopatia, jolle on tunnusomaista pikkuaivojen ja aivorungon epämuodostuma (ns. molaarihammasmerkki), lihasjänteyden heikkous, kehityksen viivästyminen ja poikkeavat silmänliikkeet. Joillakin potilailla on myös munuaisten, maksan tai silmien osallisuutta.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Perinnölliset autosomaalisesti resessiiviset pikkuaivoataksiat (mm. CANVAS ja AVED)
- Autosomaalisesti resessiivinen pikkuaivoataksiaAutosomaalinen resessiivinen
Yksi 57 siihen liittyvästä geenistä
Ryhmä resessiivisesti periytyviä ataksioita, joita aiheuttavat biallelliset variantit geeneissä, kuten RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 ja SYNE1.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
E-vitamiinin puutokseen liittyvää ataksiaa (TTPA) voidaan hoitaa E-vitamiinilisillä. Muita muotoja hoidetaan fysioterapialla ja oireenmukaisella hoidolla, ja sukulaisille voidaan tarjota kantajatestausta.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
CSPP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,9 kb geenin 132,2 kb:stä; 3 681 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CSPP1
111
CSPP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 132,2 kb geenistä CSPP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AHI1Abelson helper integration site 1Yhteisiä sairauksia: 3
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteisiä sairauksia: 3
- CEP290centrosomal protein 290Yhteisiä sairauksia: 3
- CEP41centrosomal protein 41Yhteisiä sairauksia: 3
- KIAA0586KIAA0586Yhteisiä sairauksia: 3
- MKS1MKS transition zone complex subunit 1Yhteisiä sairauksia: 3
- TMEM138transmembrane protein 138Yhteisiä sairauksia: 3
- TMEM216transmembrane protein 216Yhteisiä sairauksia: 3
- TMEM231transmembrane protein 231Yhteisiä sairauksia: 3
- TMEM237transmembrane protein 237Yhteisiä sairauksia: 3
- TMEM67transmembrane protein 67Yhteisiä sairauksia: 3
- ANO10anoctamin 10Yhteinen sairaus: 1
Geeniin CSPP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CSPP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Elongated superior cerebellar peduncle
- Lobar holoprosencephaly
- Molar tooth sign on MRI
Näytä 23 piirrettä lisää
- Small cerebellum
- Ventriculomegaly
- Abnormal basal ganglia morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormality of neuronal migration
- Abnormality of the cerebellum
- Absent septum pellucidum
- Absent speech development
- Anencephaly
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Colpocephaly
- Dilated third ventricle
- Dysgenesis of the cerebellar vermis
- Epilepsy
- Lateral ventricle dilatation
- Meningocele
- More grooves in brain
- Open operculum
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
- Small brainstem
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Encephalocele
- Cleft palate
- Decreased width of the skull
- Flat nose
- Frontal bossing
- Full cheeks
- Little lower jaw
Näytä 17 piirrettä lisää
- Long face
- Sloping forehead
- Aplasia/Hypoplasia of the tongue
- Brain tissue sticks out through back of skull
- Chronic sinus disease
- Cleft of the mouth
- Dandy-Walker malformation
- Depressed nasal bridge
- Enlarged cisterna magna
- Eye folds
- Grooved tongue
- Highly arched eyebrow
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Prominent nasal bridge
- Redundant neck skin
- Posterior fossa cyst
Abnormality of the eye
- Drooping upper eyelid
- Oculomotor apraxia
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormally small eyeball
- Absent/small iris
- Clouding of the lens of the eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Hardening of skin and connective tissue
Näytä 14 piirrettä lisää
Abnormality of the genitourinary system
- Multicystic kidney dysplasia
- Ambiguous external genitalia
- Hyperechogenic kidneys
- Undescended testes
- Cystic kidney disease
- Double ureter
- Hypospadias
- Male pseudohermaphroditism
Näytä 5 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Generalized decreased muscle tone
- Abnormal vertebral body morphology
- Absent/small outermost thorax bone
- Bell-shaped thorax
- Cervical spinal canal stenosis
- Cone-shaped end part of bone
- Long collarbone
Näytä 5 piirrettä lisää
Abnormality of the digestive system
- Excessive buildup of connective tissue and scarring of liver at birth
- Feeding difficulties in infancy
- Acid reflux
- Cystic liver disease
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Feeding difficulties
- Pancreatic cysts
- Pancreatic fibrosis
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CSPP1-geeni: centrosome and spindle pole associated protein 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cspp1
Dante Labs. CSPP1-geeni: centrosome and spindle pole associated protein 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cspp1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa