Gén
CSPP1
centrosome and spindle pole associated protein 1
- HGNC 26193↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000104218↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 79848↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 8q13.1-q13.2
- Koordináták
- 8. kromoszóma: 67 064 392–67 196 614 (GRCh38)
- Exonok
- 31 exon, összesen 132,2 kb
- Fehérje
- 1226 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- FLJ22490, CSPP, JBTS21, CSPP-L
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000678616.1NM_001382391.1
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a CSPP1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Joubert Syndrome And Related Disorders
- Autoszomális recesszív
Joubert syndrome (JS) and related disorders (JSRD) are a group of developmental delay/multiple congenital anomaly syndromes in which the mandatory feature is the "molar tooth sign'' (MTS), a complex midbrain-hindbrain malformation recognizable on brain imaging. The MTS is characterized by cerebellar vermis hypodysplasia, thickening and malorientation of the superior cerebellar peduncles and abnormally deep interpeduncular fossa.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Joubert Syndrome
A ciliopathy defined by a malformation of the cerebellum and brainstem (the molar tooth sign), with low muscle tone, developmental delay and abnormal eye movements, sometimes with kidney, liver or eye involvement.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Átfogóbb csoportosítások
Autosomal Recessive Cerebellar Ataxias (incl. CANVAS and AVED)
- Autosomal Recessive Cerebellar AtaxiaAutoszomális recesszív
A 57 hozzá kapcsolódó gén egyike
A group of recessively inherited ataxias caused by biallelic variants in genes such as RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 and SYNE1.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Ataxia with vitamin E deficiency (TTPA) is treatable with vitamin E supplements; other forms are managed with physiotherapy and symptom care, and relatives can be offered carrier testing.
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A CSPP1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 132,2 kb-jából 4,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3681 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) CSPP1 gént
111
pozíció a(z) CSPP1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a CSPP1 gén mind a 132,2 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 4,9 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AHI1Abelson helper integration site 13 betegséget oszt meg
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2A3 betegséget oszt meg
- CEP290centrosomal protein 2903 betegséget oszt meg
- CEP41centrosomal protein 413 betegséget oszt meg
- KIAA0586KIAA05863 betegséget oszt meg
- MKS1MKS transition zone complex subunit 13 betegséget oszt meg
- TMEM138transmembrane protein 1383 betegséget oszt meg
- TMEM216transmembrane protein 2163 betegséget oszt meg
- TMEM231transmembrane protein 2313 betegséget oszt meg
- TMEM237transmembrane protein 2373 betegséget oszt meg
- TMEM67transmembrane protein 673 betegséget oszt meg
- ANO10anoctamin 101 betegséget oszt meg
A(z) CSPP1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CSPP1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Elongated superior cerebellar peduncle
- Lobar holoprosencephaly
- Molar tooth sign on MRI
Még 23 tulajdonság megjelenítése
- Small cerebellum
- Ventriculomegaly
- Abnormal basal ganglia morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormality of neuronal migration
- Abnormality of the cerebellum
- Absent septum pellucidum
- Absent speech development
- Anencephaly
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Colpocephaly
- Dilated third ventricle
- Dysgenesis of the cerebellar vermis
- Epilepsy
- Lateral ventricle dilatation
- Meningocele
- More grooves in brain
- Open operculum
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
- Small brainstem
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Encephalocele
- Cleft palate
- Decreased width of the skull
- Flat nose
- Frontal bossing
- Full cheeks
- Little lower jaw
Még 17 tulajdonság megjelenítése
- Long face
- Sloping forehead
- Aplasia/Hypoplasia of the tongue
- Brain tissue sticks out through back of skull
- Chronic sinus disease
- Cleft of the mouth
- Dandy-Walker malformation
- Depressed nasal bridge
- Enlarged cisterna magna
- Eye folds
- Grooved tongue
- Highly arched eyebrow
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Prominent nasal bridge
- Redundant neck skin
- Posterior fossa cyst
Abnormality of the eye
- Drooping upper eyelid
- Oculomotor apraxia
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormally small eyeball
- Absent/small iris
- Clouding of the lens of the eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Hardening of skin and connective tissue
Még 14 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the genitourinary system
- Multicystic kidney dysplasia
- Ambiguous external genitalia
- Hyperechogenic kidneys
- Undescended testes
- Cystic kidney disease
- Double ureter
- Hypospadias
- Male pseudohermaphroditism
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Generalized decreased muscle tone
- Abnormal vertebral body morphology
- Absent/small outermost thorax bone
- Bell-shaped thorax
- Cervical spinal canal stenosis
- Cone-shaped end part of bone
- Long collarbone
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the digestive system
- Excessive buildup of connective tissue and scarring of liver at birth
- Feeding difficulties in infancy
- Acid reflux
- Cystic liver disease
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Feeding difficulties
- Pancreatic cysts
- Pancreatic fibrosis
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CSPP1 gén: centrosome and spindle pole associated protein 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cspp1
Dante Labs. CSPP1 gén: centrosome and spindle pole associated protein 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cspp1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt