Genas
ALOX12B
arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type
- HGNC 430↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000179477↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 242↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 17p13.1
- Koordinatės
- Chromosoma 17: 8 072 636–8 087 716 (GRCh38)
- Eksonai
- 15 eksonų per 15,1 kb
- Baltymas
- 701 aminorūgštis
- Taip pat žinomas kaip
- 12R-LOX
- MANE Select transkriptas
- ENST00000647874.1NM_001139.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alox12b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite ALOX12B ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Paveldimos ichtiozės
- Autosominė recesyvinė įgimta ichtiozėAutosominis recesyvinis
Recesyvinių ichtiozių grupė, įskaitant harlekino ichtiozę ir lamelinę ichtiozę, paprastai pasireiškianti gimus, dažnai su kolodijos membrana.
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Ankstyva diagnozė padeda parinkti naujagimio priežiūrą, emolientų ir keratolitikų režimą bei atsargumo priemones, kai netoleruojamas karštis.
Kaip išdėstytas ALOX12B
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,5 kb iš 15,1 kb geno; 2 106 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: ALOX12B
4Maža
Kiek sunku sekti ALOX12B trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo ALOX12B egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.1,6 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.38 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
43
ALOX12B pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 15,1 kb geno ALOX12B, įskaitant intronus, o ne tik 2,5 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ABCA12ATP binding cassette subfamily A member 12Turi 1 bendrą būklę
- ALOXE3arachidonate epidermal lipoxygenase 3Turi 1 bendrą būklę
- CERS3ceramide synthase 3Turi 1 bendrą būklę
- CSTAcystatin ATuri 1 bendrą būklę
- CYP4F22cytochrome P450 family 4 subfamily F member 22Turi 1 bendrą būklę
- KRT2keratin 2Turi 1 bendrą būklę
- LIPNlipase family member NTuri 1 bendrą būklę
- NIPAL4NIPA like domain containing 4Turi 1 bendrą būklę
- PNPLA1patatin like domain 1, omega-hydroxyceramide transacylaseTuri 1 bendrą būklę
- SDR9C7short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7Turi 1 bendrą būklę
- SERPINB8serpin family B member 8Turi 1 bendrą būklę
- ST14ST14 transmembrane serine protease matriptaseTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su ALOX12B
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti ALOX12B, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). ALOX12B genas: arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/alox12b
Dante Labs. ALOX12B genas: arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/alox12b
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites