Genă
SALL4
spalt like transcription factor 4
- HGNC 15924↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000101115↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 57167↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 20q13.2
- Coordonate
- Cromozomul 20: 51.782.331–51.802.521 (GRCh38)
- Exoni
- 4 de exoni pe 20,2 kb
- Proteină
- 1.053 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- dJ1112F19.1, ZNF797
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000217086.9NM_020436.5
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sall4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți SALL4 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă SALL4. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei SALL4
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 5,2 kb din cei 20,2 kb ai genei; 3.162 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvenţiere SALL4
33
poziţii în SALL4 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o consideră dificilă.
Un genom întreg acoperă toţi cei 20,2 kb din SALL4, inclusiv intronii, nu doar cei 5,2 kb de exoni.
ClinVar pathogenic variants (33)
The SALL4 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenă 27
- Probabil patogenă 6
| Variantă | Conditions | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_020436.5(SALL4):c.1242_1245del (p.Cys415fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020436.5(SALL4):c.516_522del (p.Gly174fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020436.5(SALL4):c.2665G>T (p.Glu889Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2593C>T (p.Arg865Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2491C>T (p.Arg831Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2456dup (p.Met819fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2424dup (p.Ala809fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2280dup (p.Asn761fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2252del (p.Asn751fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.2101del (p.Ala701fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1994_1995del (p.Phe665fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1959dup (p.Pro654fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1849C>T (p.Arg617Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1801C>T (p.Arg601Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1717C>T (p.Arg573Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1657C>T (p.Gln553Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1625del (p.Pro542fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1557del (p.Thr520fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1472C>A (p.Ser491Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1291C>T (p.Arg431Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1232del (p.Val411fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.1068del (p.Lys357fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.827dup (p.Ser276fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.712C>T (p.Gln238Ter) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020436.5(SALL4):c.563del (p.Gly188fs) (opens in a new tab) | Duane-radial ray syndrome | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
See all 33 with every other SALL4 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Trăsături asociate cu SALL4
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca SALL4. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of limbs
- Short thighbone
- Underdeveloped inner large forearm bone
- Underdeveloped outer large forearm bone
- Abnormal morphology of the radius
- Abnormality of the thumb
- Aplasia/Hypoplasia of the radius
- Short outermost bone of the thumb
- Short thumb
Afișați încă 33 de trăsături
- Small thenar eminence
- Absent thumb
- Broad bone of big toe
- Extra thumb
- Finger-like thumb
- Fused forearm bones
- Fused wrist bones
- Fusion of wrist bones
- Gap between 1st and 2nd toes
- Radial ray deficiency
- Short big toe
- Upper limb undergrowth
- Absent/small thumb
- Club feet
- Finger syndactyly
- Fused toes
- Missing outer large bone of forearm
- Preaxial polydactyly
- Short fingers or toes
- Short humerus
- Small pec muscle
- Talipes
- Absent long bone of hand
- Dropped arches
- Hypoplasia of deltoid muscle
- Limited elbow movement
- Limited movement of hinge joints
- Limited wrist movement
- Radial deviation of the hand
- Shortened 1st long bone of hand
- Small carpal bones
- Underdevelopment of upper limb muscles
- Webbed fingers or toes
Abnormality of the eye
- Abnormality of eye movement
- Abnormally small eyeball
- Cross-eyed
- Duane anomaly
- Oculomotor apraxia
- Oculomotor nerve palsy
- Deeply set eye
- Impaired ocular abduction
Afișați încă 24 de trăsături
- Impaired ocular adduction
- Optic disc coloboma
- Optic disc hypoplasia
- Paroxysmal tonic upgaze
- Visual impairment
- Abnormality of the pupil
- Absent iris
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Cat eye
- Central heterochromia
- Clouding of the lens of the eye
- Compensatory head posture
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Drooping upper eyelid
- Gustatory lacrimation
- Hypoplastic iris stroma
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Lazy eye
- Marcus Gunn jaw winking synkinesis
- Notched pupil
- Wide-set eyes
- Hole in the back of the eye
- Impaired convergence
- Paralysis or weakness of muscles within or surrounding outer part of eye
Abnormality of head or neck
- Short opening between the eyelids
- Low hairline at back of neck
- Narrow opening between the eyelids
- Nasal tip, upturned
- Abnormally small head
- Asymmetry of the posterior head
- Cleft palate
- Drooping lower lip
Afișați încă 14 de trăsături
- Eye folds
- Eyelid spasm
- Facial asymmetry
- Frontal bossing
- Little lower jaw
- Short neck
- Skin tag in front of the ear
- Webbed neck
- Wide nasal bridge
- Abnormal nasopharynx morphology
- Bell's palsy
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Palpebral fissure narrowing on adduction
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal rotation of the kidneys
- Crossed fused renal ectopia
- Horseshoe kidney
- Absent/small kidney
- Bladder diverticulum
- Abnormal kidney location
- Vesicoureteral reflux
- Absent kidney
Afișați încă 2 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.18-8b139e39.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena SALL4: spalt like transcription factor 4. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/sall4
Dante Labs. Gena SALL4: spalt like transcription factor 4 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/sall4
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni