Genă
GATM
glycine amidinotransferase
- HGNC 4175↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000171766↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 2628↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 15q21.1
- Coordonate
- Cromozomul 15: 45.361.124–45.378.544 (GRCh38)
- Exoni
- 9 de exoni pe 17,4 kb
- Proteină
- 423 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- AGAT
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000396659.8NM_001482.3
- Tip de locus
- gene with protein product
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Genom de referințăGRCh38hg38
Pozițiile de pe paginile genelor și variantelor urmează această alegere, în acest browser.
Citiți GATM și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Sindroamele de deficit cerebral de creatină
- Sindromul de deficit cerebral de creatină
Include deficitul de GAMT și de AGAT (autozomal recesiv) și deficitul transportorului de creatină (SLC6A8, legat de cromozomul X), care pot provoca deficiență intelectuală, întârziere în vorbire, convulsii și tulburări de comportament.
- ClinGen evaluează legătura drept definitivă
- 5 de evaluatori GenCC o clasifică drept definitivă sau puternică
Ce schimbă cunoașterea
Cunoașterea acestor date permite suplimentarea cu creatină, iar în cazul deficitului de GAMT, administrarea de ornitină și modificări ale dietei, care pot ameliora sau preveni simptomele defectelor de sinteză atunci când tratamentul este început din timp.
Sindromul Fanconi renotubular și glucozuria renală
- Sindrom Fanconi renotubular ereditar
Un grup de tulburări ereditare ale tubului renal proximal, cauzate de gene precum GATM, EHHADH și HNF4A, în care multe substanțe sunt pierdute prin urină, ceea ce poate afecta oasele și funcția renală.
- ClinGen evaluează legătura drept moderată
- 1 evaluator GenCC o clasifică drept definitivă sau puternică
Ce schimbă cunoașterea
Cunoașterea acestei afecțiuni permite monitorizarea funcției renale și a sănătății oaselor și, dacă este necesar, înlocuirea mineralelor pierdute.
Structura genei GATM
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
- Variante cu pagină
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 2,3 kb din cei 17,4 kb ai genei; 1.272 dintre aceste baze codifică proteina.
Cum citește un test genomic GATM
34
poziții în GATM în care ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un test genomic complet acoperă toți cei 17,4 kb ai genei GATM, inclusiv intronii, nu doar cei 2,3 kb de exoni.
Variante cu pagină (12)
Variantele GATM cu pagină aici, cu cele mai multe stele de revizuire primele. Fiecare pagină descrie înregistrarea publică a ClinVar despre variantă, niciodată un rezultat.
| Variantă | HGVS c. | Exon sau intron | Poziție (GRCh38) | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|---|---|
| A185P | c.553G>C | Exon 4 | 45.368.192 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| c.484+1G>T | Intron 3 | 45.369.325 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| M371Nfs*6 | c.1111dup | Exon 8 | 45.363.947 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| P320Lfs*41 | c.959del | Exon 6 | 45.366.064 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R169X | c.505C>T | Exon 4 | 45.368.240 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R260X | c.778C>T | Exon 5 | 45.366.406 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R413Q | c.1238G>A | Exon 9 | 45.362.143 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R413W | c.1237C>T | Exon 9 | 45.362.144 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| W72X | c.216G>A | Exon 2 | 45.376.673 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| W149X | c.446G>A | Exon 3 | 45.369.364 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
Gene asociate acelorași afecțiuni
Trăsături asociate cu GATM
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca GATM. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Laboratory abnormality
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Decreased urine guanidinoacetic acid level
- Elevated alkaline phosphatase
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- Low-molecular-weight proteinuria
- Metabolic acidosis
- Reduced tissue arginine:glycine amidinotransferase activity
Afișați încă 24 de trăsături
- Abnormal urine pH
- Bicarbonate-wasting renal tubular acidosis
- Bicarbonaturia
- Generalized aminoaciduria
- High urine uric acid level
- Hyperchloremic metabolic acidosis
- Proximal renal tubular acidosis
- Renal phosphate wasting
- Decreased circulating guanidinoacetic acid concentration
- Decreased CSF creatinine concentration
- Decreased serum creatinine
- Decreased urinary creatine level
- Decreased urine creatinine level
- Increased urinary potassium
- Low blood phosphate level
- Low blood potassium levels
- Low blood uric acid levels
- Reduced circulating creatine concentration
- Renal sodium wasting
- Dehydration
- Elevated urine calcium levels
- Low blood sugar
- High urine lactic acid levels
- Organic aciduria
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Intellectual disability
- Reduced brain creatine level by MRS
- Cognitive impairment
- Global developmental delay
- Delayed speech and language development
- Simple febrile seizure
Afișați încă 4 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, publicate în 2026-10-16: de care afecțiuni este legată gena și cât de puternică este legătura.
- Lista ACMG de descoperiri secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena GATM: glycine amidinotransferase. Accesat 16 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/gatm
Dante Labs. Gena GATM: glycine amidinotransferase [Internet]. [citat 16 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/gatm
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni