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유전자

GATM

glycine amidinotransferase

요약

세포유전학적 위치
15q21.1
좌표
염색체 15: 45,361,124–45,378,544 (GRCh38)
엑손
엑손 9개, 17.4 kb에 걸쳐
단백질
아미노산 423개
다른 이름
AGAT
MANE Select 전사체
ENST00000396659.8NM_001482.3
유전자좌 유형
gene with protein product
  • Very high
  • Confident
  • Low
  • Very low

기준 게놈GRCh38

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이 유전자와 관련된 큐레이션 보고서

  • 뇌 크레아틴 결핍 증후군

    • GAMT 및 AGAT 결핍증(상염색체 열성)과 크레아틴 운반체 결핍증(SLC6A8, X 연관)을 포함하며, 지적 장애, 언어 발달 지연, 발작 및 행동 문제를 유발할 수 있습니다.

      • ClinGen의 이 연관성 평가: 확정적
      • 5명의 GenCC 제출자가 확정적 또는 강함으로 평가합니다
      알면 달라지는 점

      이를 알면 크레아틴 보충이 가능하며, GAMT 결핍증의 경우 오르니틴 보충과 식이 조절을 함께 할 수 있습니다. 합성 결함은 조기에 시작하면 증상이 호전되거나 예방될 수 있습니다.

  • 판콘 신세뇨관 증후군과 신성 당뇨

    • 유전성 판콘 신세뇨관 증후군

      GATM, EHHADH, HNF4A 등의 유전자에 의해 발생하는 근위 세뇨관 유전 질환 집단으로, 여러 물질이 소변으로 손실되며 이는 뼈와 신장 기능에 영향을 줄 수 있습니다.

      • ClinGen의 이 연관성 평가: 중등도
      • 1명의 GenCC 제출자가 확정적 또는 강함으로 평가합니다
      알면 달라지는 점

      이를 알면 신장 기능과 뼈 건강을 모니터링하고, 필요한 경우 손실된 미네랄을 보충할 수 있습니다.

GATM의 구조

  • 코딩 서열
  • 비번역 영역
  • 인트론
  • 전사 방향
  • 알려진 질병 유발 부위
  • 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간
  • 페이지가 있는 변이
Chromosome 15, with a bracket where GATM sits. GATM and 14 genes near it on chromosome 15, from 44,869,834 to 45,869,833.Chromosome 1515q21.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.345 Mb45.2 Mb45.4 Mb45.6 Mb45.8 MbTERB2: 44,956,687–44,979,229, 정방향 strandTERB2SORD: 45,023,116–45,077,185, 정방향 strandSORDDUOX2: 45,092,650–45,114,185, 역방향 strandDUOX2DUOXA2: 45,114,325–45,118,421, 정방향 strandDUOXA2DUOXA1: 45,117,364–45,130,611, 역방향 strandDUOXA1DUOX1: 45,129,450–45,165,576, 정방향 strandDUOX1SHF: 45,165,572–45,201,175, 역방향 strandSHFSLC28A2: 45,252,227–45,277,846, 정방향 strandSLC28A2GATM: 45,361,124–45,378,544, 역방향 strandGATMAFG2B: 45,402,325–45,421,415, 정방향 strandAFG2BCOXFA4L3: 45,430,579–45,448,761, 정방향 strandCOXFA4L3SLC30A4: 45,479,606–45,522,834, 역방향 strandSLC30A4BLOC1S6: 45,587,108–45,615,945, 정방향 strandBLOC1S6: 45,587,351–45,676,314, 정방향 strandSQOR: 45,631,148–45,691,299, 정방향 strandSQORGATM 도식: 염색체 15의 역방향 가닥에 있는 엑손 9개엑손 9: 알려진 질병 유발 부위 2곳엑손 8: 알려진 질병 유발 부위 2곳엑손 7: 알려진 질병 유발 부위 1곳엑손 6: 알려진 질병 유발 부위 3곳엑손 5: 알려진 질병 유발 부위 2곳엑손 4: 알려진 질병 유발 부위 6곳엑손 3: 알려진 질병 유발 부위 3곳엑손 2: 알려진 질병 유발 부위 7곳엑손 1: 알려진 질병 유발 부위 2곳엑손 9: 45,361,124–45,362,221, 1,098 염기. 엑손 9에 페이지가 있는 변이 2개. 목록 보기엑손 8: 45,363,900–45,364,016, 117 염기. 엑손 8에 페이지가 있는 변이 1개. 목록 보기엑손 7: 45,364,797–45,364,860, 64 염기엑손 6: 45,366,046–45,366,210, 165 염기. 엑손 6에 페이지가 있는 변이 1개. 목록 보기엑손 5: 45,366,371–45,366,508, 138 염기. 엑손 5에 페이지가 있는 변이 1개. 목록 보기엑손 4: 45,368,070–45,368,260, 191 염기. 엑손 4에 페이지가 있는 변이 4개. 목록 보기엑손 3: 45,369,326–45,369,521, 196 염기. 엑손 3에 페이지가 있는 변이 1개. 목록 보기엑손 2: 45,376,601–45,376,819, 219 염기. 엑손 2에 페이지가 있는 변이 1개. 목록 보기엑손 1: 45,378,385–45,378,544, 160 염기9876543215′3′

v1.5 릴리스 기준, 이 유전자의 MANE Select 전사체 엑손이며 NCBI와 EMBL-EBI 자료를 바탕으로 하고 GRCh38 참조 게놈에 기반합니다.

Chromosome bands from UCSC's GRCh38 ideogram (2022-10-29).

Nearby genes from Ensembl release 116, on GRCh38.

유전자 전체 17.4 kb 중 엑손이 2.3 kb를 차지하며, 이 중 1,272개의 염기가 단백질을 암호화합니다.

전장 유전체 검사가 GATM 유전자를 읽는 방법

34

GATM 내 위치 중 ClinVar가 병원성 또는 가능성 높은 병원성으로 분류하는 위치

이 중 어느 곳도 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간에 있지 않습니다.

전장 유전체 검사는 인트론을 포함해 GATM의 전체 17.4kb를 모두 포함하며, 엑손 2.3kb만 보는 것이 아닙니다.

페이지가 있는 변이 (12)

여기에 페이지가 있는 GATM 변이를 리뷰 별점이 많은 순으로 보여 드립니다. 각 페이지는 ClinVar가 공개한 변이 기록을 설명하며, 검사 결과는 아닙니다.

변이HGVS c.엑손 또는 인트론위치 (GRCh38)ClinVar 분류리뷰 상태
A185Pc.553G>C엑손 445,368,192가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
c.484+1G>T인트론 345,369,325병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
M371Nfs*6c.1111dup엑손 845,363,947병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
P320Lfs*41c.959del엑손 645,366,064가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
R169Xc.505C>T엑손 445,368,240병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
R260Xc.778C>T엑손 545,366,406가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
R413Qc.1238G>A엑손 945,362,143가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
R413Wc.1237C>T엑손 945,362,144가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
W72Xc.216G>A엑손 245,376,673가능성 높은 병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료
W149Xc.446G>A엑손 345,369,364병원성4개 중 3개 별 전문가 패널 검토 완료

GATM 변이 12개 모두 보기 →

이 정보의 출처

  • HGNC: 유전자의 기호, 명칭, 다른 기호 및 위치입니다.
  • NCBI와 EMBL-EBI의 MANE Select v1.5: 전사체, 엑손 및 코딩 서열입니다.
  • GenCC와 ClinGen, 2026-10-16 공개본: 해당 유전자와 연관된 질환과 그 연관성의 강도입니다.
  • ACMG 이차 소견 목록, SF v3.2입니다.
  • ClinVar와 GIAB 층화 자료: 알려진 질병 유발 부위와 짧은 리드(short read)로 분석하기 어려운 영역입니다.
  • The Human Phenotype Ontology, release 2026-09-01: the traits linked to the gene. Find out more at hpo.jax.org.
  • 데이터 릴리스 2026.10.16-c6eea6bf.

Cite this page

APA

Dante Labs. (n.d.). GATM gene: glycine amidinotransferase. Retrieved 2026년 10월 16일, from https://dantelabs.com/ko/genes/gatm

Vancouver

Dante Labs. GATM gene: glycine amidinotransferase [Internet]. [cited 2026년 10월 16일]. Available from: https://dantelabs.com/ko/genes/gatm

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