Geeni
GJC2
gap junction protein gamma 2
- HGNC 17494↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000198835↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 57165↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q42.13
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 228 149 930–228 159 826 (GRCh38)
- Eksonit
- 2 eksonia 9,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 439 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CX47, CX46.6, SPG44
- Aiemmat symbolit
- GJA12
- MANE Select -transkripti
- ENST00000366714.3NM_020435.4
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gjc2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue GJC2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Pelizaeus-Merzbacherin tauti ja hypomyelinoivat leukodystrofiat
- Pelizaeus-Merzbacherin tautia muistuttava tila (GJC2 ja muut geenit)Autosomaalinen resessiivinen
Tila, joka muistuttaa läheisesti Pelizaeus-Merzbacherin tautia. Sitä aiheuttavat useimmiten GJC2-geenin muutokset, ja siihen liittyy varhainen nystagmus, viivästynyt kehitys ja myöhemmin spastisuus.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Ensisijainen lymfedeema ja lymfaattiset malformaatiot
- Lymfaattinen malformaatio 3Autosomaalinen dominantti
GJC2-geenin muutosten aiheuttama perinnöllinen lymfedeema, joka yleensä alkaa lapsuudessa tai nuoruudessa.
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Laajemmat ryhmät
Perinnöllinen spastinen paraplegia
- Perinnöllinen spastinen paraplegia (kaikki tyypit)
Yksi 66 siihen liittyvästä geenistä
Yhteisnimitys kaikille perinnöllisille spastisille paraplegioille, mukaan lukien SPG4 (SPAST), yleisin dominantti muoto, sekä SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
Muut perinnölliset leukodystrofiat
- Leukodystrofia (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 80 siihen liittyvästä geenistä
Perinnölliset sairaudet, jotka vahingoittavat myeliinituppea eli aivojen ja selkäytimen valkeaa ainetta tai estävät sen normaalin muodostumisen. Eri tyypit periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, autosomaalisesti dominantisti tai X-kromosomaalisesti sen mukaan, mikä geeni on kyseessä.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedossa oleva geneettinen syy voi lopettaa diagnoosin etsimisen, ohjata tukihoitoa ja seurantaa, osoittaa, onko olemassa tiettyä hoitoa, sekä mahdollistaa sukulaisten testauksen.
GJC2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,2 kb geenin 9,9 kb:stä; 1 320 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: GJC2
56
GJC2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 9,9 kb geenistä GJC2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 2,2 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- HSPD1heat shock protein family D (Hsp60) member 1Yhteisiä sairauksia: 3
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- PLP1proteolipid protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseYhteinen sairaus: 1
- ACER3alkaline ceramidase 3Yhteinen sairaus: 1
- ADARadenosine deaminase RNA specificYhteinen sairaus: 1
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin GJC2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita GJC2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Babinski sign
- Choreoathetosis
- CNS hypomyelination
- Difficulty articulating speech
- Increased reflexes
- Motor delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Näytä 23 piirrettä lisää
- Abnormal auditory evoked potentials
- Abnormal motor evoked potentials
- Abnormality of somatosensory evoked potentials
- Abnormal gait
- Cognitive impairment
- Decreased sensation in extremities
- Epilepsy
- Focal impaired awareness seizure
- Somatic sensory dysfunction
- Delayed motor skills
- Focal aware seizure
- Cerebral hypomyelination
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebrum
- Demyelinating motor neuropathy
- Dystonia
- Global developmental delay
- Head titubation
- Intention tremor
- Lack of coordination of movement
- Leukodystrophy
- Poor speech
- Sensory axonal neuropathy
Abnormality of the musculoskeletal system
- Lower limb spasticity
- Poor head control
- Spastic paraparesis
- Spastic paraplegia
- Spastic walk
- Uncontrollable movement in upper arms
- Scoliosis
- Bacterial infection of skin
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). GJC2-geeni: gap junction protein gamma 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gjc2
Dante Labs. GJC2-geeni: gap junction protein gamma 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gjc2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa