Geeni
ALDH3A2
aldehyde dehydrogenase 3 family member A2
- HGNC 403↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000072210↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 224↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 17p11.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 17: 19 648 751–19 677 596 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 28,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 485 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FALDH
- Aiemmat symbolit
- SLS, ALDH10
- MANE Select -transkripti
- ENST00000176643.11NM_000382.3
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/aldh3a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue ALDH3A2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Perinnölliset neurodegeneratiiviset sairaudet
- KIF5A-geenin aiheuttama neurodegeneratiivinen sairausAutosomaalinen dominantti
Yksi 372 siihen liittyvästä geenistä
Aiheutuu muutoksesta yhdessä KIF5A-geenin kopiossa. Geeni koodaa motorista proteiinia, jolla on rakenteeseen sitoutuva häntäosa. Eri tyyppiset muutokset johtavat eri sairauksiin: perinnölliseen spastiseen parapleginen tyyppiin 10, Charcot-Marie-Toothin taudin aksonaaliseen muotoon ja amyotrofiseen lateraaliskleroosiin (ALS).
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Hoito on oireenmukaista ja riippuu oireista. Siihen kuuluvat fysioterapia, spastisuuden lääkitys ja moniammatillinen ALS-hoito. Sairastuneen jokaisella lapsella on 1/2 todennäköisyys periä muutos. Perinnöllisyysneuvonta auttaa perheitä ymmärtämään tätä.
Muut perinnölliset leukodystrofiat
- Leukodystrofia (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 80 siihen liittyvästä geenistä
Perinnölliset sairaudet, jotka vahingoittavat myeliinituppea eli aivojen ja selkäytimen valkeaa ainetta tai estävät sen normaalin muodostumisen. Eri tyypit periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, autosomaalisesti dominantisti tai X-kromosomaalisesti sen mukaan, mikä geeni on kyseessä.
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedossa oleva geneettinen syy voi lopettaa diagnoosin etsimisen, ohjata tukihoitoa ja seurantaa, osoittaa, onko olemassa tiettyä hoitoa, sekä mahdollistaa sukulaisten testauksen.
ALDH3A2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,7 kb geenin 28,8 kb:stä; 1 458 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
ALDH3A2-geenin sekvensointi
2Helppo
Kuinka vaikea ALDH3A2-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100
0 · Helppo100 · Vaikea
Lähes kaikki ALDH3A2-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.
Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa ALDH3A2-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.
- KartoitettavuusKohdat, joissa 100 tai 250 bp:n lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten muutos siellä voi puuttua tai olla väärä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 100.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paralogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identiteetillä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 60.0 %
- Yhteinen chrY:n kanssaPseudoautosomaaliset alueet ja X-transponoitu alue, joissa chrX ja chrY sisältävät saman tai lähes saman sekvenssin, joten toisesta kromosomista luettu lukema voidaan sijoittaa toiseen. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 60.0 %
- Referenssin kattavuusLäheisissä kohdissa referenssikokoonpanossa on aukkoja, joihin lukemat eivät voi kohdistua, koska sekvenssiä ei ole. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 50.0 %
- ToistotTandem-toistot ja yhden emäksen jaksot, joiden kohdalla lukemat luiskahtavat eivätkä välttämättä kata niitä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 30.0,6 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %; kirjastovalmistus kattaa ne ohuesti. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 20.10 %
Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaanJokainen palkki on sen vaikean aluetyypin osuus ALDH3A2-geenin eksonien emäksistä. Mikä tahansa yksittäinen tyyppi voi tehdä geenistä vaikean yksinäänkin, ja jokainen lisätyyppi lisää vähemmän: 0, kun mikään emäs ei ole missään, 100, kun jokainen emäs on kohdassa, johon lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti.
121
kohtaa ALDH3A2-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat hankaloittavat.
Koko genomi kattaa koko ALDH3A2-geenin, 28,8 kb, intronit mukaan lukien, eikä pelkkiä 3,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteisiä sairauksia: 2
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ACER3alkaline ceramidase 3Yhteisiä sairauksia: 2
- ADARadenosine deaminase RNA specificYhteisiä sairauksia: 2
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Yhteisiä sairauksia: 2
- ARSAarylsulfatase AYhteisiä sairauksia: 2
- ASPAaspartoacylaseYhteisiä sairauksia: 2
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AYhteisiä sairauksia: 2
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CLDN11claudin 11Yhteisiä sairauksia: 2
Geeniin ALDH3A2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita ALDH3A2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Abnormal dentition
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Coarse facial features
- Decreased facial muscle tone
- Dental cavities
- Excessive salivation
Näytä 5 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-19: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.19-9814e911.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ALDH3A2-geeni: aldehyde dehydrogenase 3 family member A2. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/aldh3a2
Dante Labs. ALDH3A2-geeni: aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/aldh3a2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa