Gen
MARS1
methionyl-tRNA synthetase 1
- HGNC 6898↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000166986↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 4141↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 12q13.3
- Koordinater
- Kromosom 12: 57 488 068–57 516 652 (GRCh38)
- Eksoner
- 21 eksoner over 28,6 kb
- Protein
- 900 aminosyrer
- Også kjent som
- MetRS, SPG70, CMT2U
- Tidligere symboler
- MARS
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000262027.10NM_004990.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mars1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes MARS1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Dysfunksjon i surfaktantmetabolismen
- Arvelig alveolær proteinose og surfaktantdysfunksjon
Arvelige forstyrrelser i produksjon eller fjerning av surfaktant, inkludert forstyrrelser forårsaket av SFTPB, SFTPC, ABCA3, CSF2RA, CSF2RB og MARS1, som strekker seg fra dødelig respirasjonssvikt hos nyfødte til interstitiell lungesykdom hos barn og voksne.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Å vite dette kan bidra til tidligere diagnose, spesialisert lungebehandling, vurdering av helelunge-lavasje eller transplantasjon der det er aktuelt, og informasjon til familieplanlegging.
Bredere grupperinger
Charcot-Marie-Tooth-sykdom
Ett av 62 gener knyttet til den
En gruppe arvelige perifere nevropatier som gir progressiv svakhet og atrofi i de distale musklene og tap av sensibilitet, hovedsakelig i føtter og hender.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Genetisk veiledning, undertypespesifikk oppfølging, fysioterapi, ortopediske hjelpemidler, unngåelse av nevrotoksiske legemidler, genspesifikke kliniske studier, overvåking for tilknyttede symptomer
Sjeldne arvelige perifere nevropatier
- Arvelig perifer nevropati
Ett av 233 gener knyttet til den
Forårsaket av endringer i ett av mange gener som trengs for å holde lange nervefibre friske. I denne rapporten gjelder dette blant annet IGHMBP2 og PLEKHG5, som er recessive.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Fysioterapi, ortoser og ergoterapi bidrar til å opprettholde bevegelighet, og kirurgi for fotdeformiteter gjøres ved behov. Noen former krever oppfølging av pusten. Genetisk veiledning hjelper til med testing av familie etter arvemønsteret for det aktuelle genet.
Slik er MARS1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,8 kb av genets 28,6 kb, og 2 703 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av MARS1
1Lett
Hvor vanskelig MARS1 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til MARS1 ligger der korte leser kartlegges godt.
Det som bidrar: andelen av eksonene til MARS1 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en påvisning der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser kan glippe på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0,6 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som bibliotekforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.4,7 %
- ReferansedekningHull i den nærliggende referanseassembleringen, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Vekt 10 %.0 %
En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbaser i MARS1 i den typen vanskelig område. Én type kan i seg selv gjøre et gen vanskelig, og hver ekstra type bidrar mindre: 0 når ingen baser er i noen, 100 når alle baser ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
3
posisjoner i MARS1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 28,6 kb av MARS1, inkludert introner, ikke bare de 2,8 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (3)
The MARS1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 1
- Sannsynligvis patogen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004990.4(MARS1):c.2426del (p.Gln809fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2U | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_004990.4(MARS1):c.1133_1134del (p.Phe378fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive spastic paraplegia type 70 and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_004990.4(MARS1):c.1547A>G (p.Tyr516Cys) (opens in a new tab) | severe early-onset pulmonary alveolar proteinosis due to MARS deficiency | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 2 tilstander
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deler 2 tilstander
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Deler 2 tilstander
- CADM3cell adhesion molecule 3Deler 2 tilstander
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Deler 2 tilstander
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Deler 2 tilstander
- DHX9DExH-box helicase 9Deler 2 tilstander
- DNM2dynamin 2Deler 2 tilstander
- DRP2dystrophin related protein 2Deler 2 tilstander
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Deler 2 tilstander
- EGR2early growth response 2Deler 2 tilstander
- FBLN5fibulin 5Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til MARS1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene MARS1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal muscle wasting
- Double-Jointed
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Muscle degeneration
- Weakness of outermost muscles
- Lower limb spasticity
- Progressive spastic paraplegia
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-8b139e39.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). MARS1-genet: methionyl-tRNA synthetase 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/mars1
Dante Labs. MARS1-genet: methionyl-tRNA synthetase 1 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/mars1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker