Genas
ATP6V1B2
ATPase H+ transporting V1 subunit B2
- HGNC 854↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000147416↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 526↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 8p21.3
- Koordinatės
- Chromosoma 8: 20 197 381–20 221 696 (GRCh38)
- Eksonai
- 14 eksonų per 24,3 kb
- Baltymas
- 511 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- VATB, Vma2, HO57
- Ankstesni simboliai
- VPP3, ATP6B2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000276390.7NM_001693.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp6v1b2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite ATP6V1B2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
DOORS sindromas
DOORS sindromą dažnai sukelia abiejų TBC1D24 kopijų pokyčiai. Šis genas dalyvauja nervinių ląstelių signalizacijoje ir membranų transportavime, o paveldėjimas yra autosominis recesyvinis. Vienos ATP6V1B2 kopijos pokytis taip pat gali sukelti DOORS sindromą; jis gali būti susijęs su giminingu DDOD sindromu.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Gydymas apima klausos pagalbą, pavyzdžiui, kochlearinius implantus, traukulių gydymą ir neurologinę priežiūrą, taip pat vystymosi ir ugdymo paramą. Rekomenduojama genetinė konsultacija: dėl TBC1D24 tėvai dažniausiai yra nešiotojai, o pasikartojimo rizika – 1 iš 4. Dėl ATP6V1B2 tėvų tyrimas padeda įvertinti riziką.
Platesnės grupės
Epilepsija (pilnas tyrimas)
- Epilepsija
Susijusi su 171 genu
Smegenų sutrikimas, pasireiškiantis epizodais, kai neuronai nenormaliai intensyviai išsikrauna, dėl ko atsiranda trumpalaikiai jutimo ar judesio neurologinio funkcijos sutrikimo arba psichikos funkcijos sutrikimo epizodai. Šie epizodai gali būti susiję arba nesusiję su sąmonės netekimu ar traukuliais.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas ATP6V1B2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,9 kb iš 24,3 kb geno; 1 536 šių bazių koduoja baltymą.
ATP6V1B2 sekvenavimas
1Lengva
Kaip sunku sekvenuoti ATP6V1B2 trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi ATP6V1B2 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.
Dar prisideda: kiekvienos rūšies sunkių sričių dalis tarp ATP6V1B2 eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kur 100 ar 250 bp skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba klaidingas. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 100 balų.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kitose genomo vietose, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Bendra su chrYPseudoautosominiai regionai ir X perkelta sritis, kur chrX ir chrY turi tą pačią arba beveik tą pačią seką, todėl skaitinys iš vieno gali būti susietas su kitu. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys spragos nuorodinėje sekoje, kur skaitiniams nėra su kuo lygiuotis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 50 balų.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido ilgos sekos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neperdengti jų. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 30 balų.0 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu apimami menkai. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 20 balų.5,7 %
„Dante Labs“ rezultatas, sudarytas remiantis mūsų pačių tyrimais ir NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamaKiekvienas stulpelis rodo ATP6V1B2 eksonų bazių dalį tos rūšies sunkioje srityje. Bet kuri viena rūšis gali pati savaime padaryti geną sunkiai sekvenuojamu, o kiekviena papildoma rūšis prideda vis mažiau: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė yra vietoje, kur skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti.
10
ATP6V1B2 pozicijos, kuriose ClinVar pakeitimus priskiria patogeniniams arba tikriausiai patogeniniams
Nė viena jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai nuskaito.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 24,3 kb ATP6V1B2 geno, įskaitant intronus, o ne tik 2,9 kb eksonų.
ClinVar pathogenic variants (11)
The ATP6V1B2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeninis 3
- Tikriausiai patogeninis 8
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1516C>T (p.Arg506Ter) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 and 1 other | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1121A>G (p.Glu374Gly) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1443G>A (p.Trp481Ter) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.124C>T (p.Gln42Ter) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.487C>G (p.Arg163Gly) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.981G>A (p.Met327Ile) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 and 1 other | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.983A>G (p.Tyr328Cys) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1057A>T (p.Ile353Phe) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1120G>C (p.Glu374Gln) (opens in a new tab) | Zimmermann-Laband syndrome 2 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1516C>G (p.Arg506Gly) (opens in a new tab) | autosomal dominant deafness - onychodystrophy syndrome | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_001693.4(ATP6V1B2):c.1517G>A (p.Arg506Gln) (opens in a new tab) | autosomal dominant deafness - onychodystrophy syndrome | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- TBC1D24TBC1 domain family member 24Turi 2 bendrų būklių
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Turi 1 bendrą būklę
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ACTL6Bactin like 6BTuri 1 bendrą būklę
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Turi 1 bendrą būklę
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Turi 1 bendrą būklę
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Turi 1 bendrą būklę
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorTuri 1 bendrą būklę
- ARXaristaless related homeoboxTuri 1 bendrą būklę
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su ATP6V1B2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti ATP6V1B2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of head or neck
- Cleft nasal tip
- Gingival fibromatosis
- Gum enlargement
- High forehead
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Wide nasal base
- Wide nasal bridge
Rodyti dar 51 savybę
- Abnormal dentition
- Abnormally large tongue
- Absence of overlap of anterior upper and lower teeth
- Bulbous nose
- Coarse facial features
- Deep philtrum
- Downturned corners of mouth
- Eye folds
- Failure of development of more than six teeth
- Full lips
- Full lower lip
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Monobrow
- Open mouth
- Prominent nasal septum
- Short neck
- Thick eyebrow
- Thickened skin folds of neck
- Thin red part of the upper lip
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide mouth
- Wide nose
- Widow's peak
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Absence of a tooth
- Bifid uvula
- Broad head shape
- Broad nasal tip
- Cleft palate
- Cone shaped tooth
- Corners of eye widely separated
- Delayed eruption of permanent teeth
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Early closure of midline skull joint
- Extra teeth
- Failure of development of between one and six teeth
- Frontal bossing
- High palate
- Little lower jaw
- Long, narrow head
- Macrodontia of permanent maxillary central incisor
- Narrow palate
- Prominent back of the head
- Short lingual frenulum
- Small, cone shaped teeth
- Wide gum ridges
- Widely spaced teeth
- Anterior flat head syndrome
- Dandy-Walker malformation
Abnormality of the integument
- Absent fifth fingernail
- Absent nails
- Absent thumbnail
- Absent toenail
- Poor nail formation
- Small nail
- Abnormal fingernails
- Abnormal toenail development
Rodyti dar 13 savybių
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Decreased muscle tone in infant
- Double-Jointed
- Generalized decreased muscle tone
- Hunched back
- 11 pairs of ribs
- Lumbar scoliosis
- Missing part of vertebrae
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-19: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.19-9814e911.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). ATP6V1B2 genas: ATPase H+ transporting V1 subunit B2. Pasiekta 2026 m. spalio 20 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/atp6v1b2
Dante Labs. ATP6V1B2 genas: ATPase H+ transporting V1 subunit B2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 20 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/atp6v1b2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites