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Gène

TRIO

trio Rho guanine nucleotide exchange factor

Résumé

Localisation cytogénétique
5p15.2
Coordonnées
Chromosome 5 : 14 143 342–14 510 204 (GRCh38)
Exons
57 exons sur 366,9 kb
Protéine
3 097 acides aminés
Aussi appelé
ARHGEF23
Transcrit MANE Select
ENST00000344204.9NM_007118.4
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    • Déficience intellectuelle

      • L'un des 233 gènes qui lui sont liés

        • ClinGen classe ce lien comme définitif
        • 6 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

    Structure de TRIO

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de TRIO. TRIO et 4 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 13 776 479 à 14 877 067.Chromosome 55p15.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.313,8 Mb14 Mb14,2 Mb14,4 Mb14,6 Mb14,8 MbDNAH5 : 13 690 328–14 011 818, brin inverseDNAH5TRIO : 14 143 342–14 510 204, brin directTRIOOTULINL : 14 581 792–14 616 180, brin directOTULINLOTULIN : 14 664 664–14 716 529, brin directOTULINANKH : 14 704 800–14 871 949, brin inverseANKHSchéma de TRIO : 57 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 5 : 6 sites connus associés à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 2 sites connus associés à une maladieExon 11 : 2 sites connus associés à une maladieExon 13 : 3 sites connus associés à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 16 : 1 site connu associé à une maladieExon 19 : 4 sites connus associés à une maladieExon 22 : 2 sites connus associés à une maladieExon 24 : 2 sites connus associés à une maladieExon 26 : 1 site connu associé à une maladieExon 28 : 5 sites connus associés à une maladieExon 29 : 6 sites connus associés à une maladieExon 30 : 1 site connu associé à une maladieExon 31 : 2 sites connus associés à une maladieExon 35 : 3 sites connus associés à une maladieExon 36 : 1 site connu associé à une maladieExon 37 : 2 sites connus associés à une maladieExon 38 : 2 sites connus associés à une maladieExon 39 : 1 site connu associé à une maladieExon 40 : 1 site connu associé à une maladieExon 41 : 1 site connu associé à une maladieExon 42 : 2 sites connus associés à une maladieExon 46 : 3 sites connus associés à une maladieExon 48 : 9 sites connus associés à une maladieExon 1 : 14 143 342–14 143 882, 541 basesExon 2 : 14 270 825–14 270 899, 75 basesExon 3 : 14 280 322–14 280 436, 115 basesExon 4 : 14 286 871–14 287 063, 193 basesExon 5 : 14 290 716–14 291 228, 513 basesExon 6 : 14 293 012–14 293 134, 123 basesExon 7 : 14 297 072–14 297 263, 192 basesExon 8 : 14 304 461–14 304 592, 132 basesExon 9 : 14 316 513–14 316 743, 231 basesExon 10 : 14 330 778–14 330 900, 123 basesExon 11 : 14 336 536–14 336 727, 192 basesExon 12 : 14 358 178–14 358 347, 170 basesExon 13 : 14 359 357–14 359 531, 175 basesExon 14 : 14 363 732–14 363 927, 196 basesExon 15 : 14 364 650–14 364 816, 167 basesExon 16 : 14 366 860–14 366 979, 120 basesExon 17 : 14 368 708–14 368 899, 192 basesExon 18 : 14 369 374–14 369 523, 150 basesExon 19 : 14 374 229–14 374 343, 115 basesExon 20 : 14 378 012–14 378 127, 116 basesExon 21 : 14 381 130–14 381 252, 123 basesExon 22 : 14 387 438–14 387 632, 195 basesExon 23 : 14 387 732–14 387 847, 116 basesExon 24 : 14 388 613–14 388 679, 67 basesExon 25 : 14 389 289–14 389 398, 110 basesExon 26 : 14 390 231–14 390 300, 70 basesExon 27 : 14 390 901–14 390 990, 90 basesExon 28 : 14 394 038–14 394 130, 93 basesExon 29 : 14 397 043–14 397 154, 112 basesExon 30 : 14 398 880–14 399 070, 191 basesExon 31 : 14 400 963–14 401 064, 102 basesExon 32 : 14 405 848–14 405 990, 143 basesExon 33 : 14 406 573–14 406 672, 100 basesExon 34 : 14 419 778–14 420 021, 244 basesExon 35 : 14 461 019–14 461 311, 293 basesExon 36 : 14 462 755–14 462 925, 171 basesExon 37 : 14 465 545–14 465 640, 96 basesExon 38 : 14 471 318–14 471 466, 149 basesExon 39 : 14 472 592–14 472 658, 67 basesExon 40 : 14 473 994–14 474 097, 104 basesExon 41 : 14 476 894–14 476 963, 70 basesExon 42 : 14 479 261–14 479 350, 90 basesExon 43 : 14 479 919–14 480 011, 93 basesExon 44 : 14 481 234–14 481 284, 51 basesExon 45 : 14 481 541–14 481 618, 78 basesExon 46 : 14 482 582–14 482 773, 192 basesExon 47 : 14 485 069–14 485 246, 178 basesExon 48 : 14 487 464–14 488 260, 797 basesExon 49 : 14 492 567–14 492 814, 248 basesExon 50 : 14 496 879–14 497 017, 139 basesExon 51 : 14 497 847–14 497 874, 28 basesExon 52 : 14 498 089–14 498 251, 163 basesExon 53 : 14 498 519–14 498 640, 122 basesExon 54 : 14 502 579–14 502 657, 79 basesExon 55 : 14 504 393–14 504 593, 201 basesExon 56 : 14 507 122–14 507 260, 139 basesExon 57 : 14 507 880–14 510 204, 2 325 bases11020304050575′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 11,5 kb sur les 366,9 kb du gène ; 9 294 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit TRIO

    80

    positions dans TRIO où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 366,9 kb de TRIO, introns compris, et pas seulement les 11,5 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène TRIO : trio Rho guanine nucleotide exchange factor. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trio

    Vancouver

    Dante Labs. Gène TRIO : trio Rho guanine nucleotide exchange factor [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trio

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