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Gène

PPP2R5C

protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma

Résumé

Localisation cytogénétique
14q32.31
Coordonnées
Chromosome 14 : 101 761 709–101 927 977 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 166,3 kb
Protéine
579 acides aminés
Aussi appelé
B56G, PR61G, B56gamma
Transcrit MANE Select
ENST00000694906.1NM_001352913.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PPP2R5C. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PPP2R5C

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de PPP2R5C. PPP2R5C et 7 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 101 344 843 à 102 344 842.Chromosome 1414q32.31p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.33101,4 Mb101,6 Mb101,8 Mb102 Mb102,2 MbDIO3 : 101 560 139–101 563 452, brin directDIO3PPP2R5C : 101 761 709–101 927 977, brin directPPP2R5CDYNC1H1 : 101 964 519–102 056 443, brin directDYNC1H1HSP90AA1 : 102 080 738–102 139 773, brin inverseHSP90AA1WDR20 : 102 139 503–102 224 847, brin directWDR20MOK : 102 224 500–102 305 193, brin inverseMOKZNF839 : 102 317 377–102 344 638, brin directZNF839CINP : 102 341 102–102 362 916, brin inverseCINPSchéma de PPP2R5C : 16 exons sur le brin direct du chromosome 14Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 101 761 709–101 761 920, 212 basesExon 2 : 101 762 905–101 762 970, 66 basesExon 3 : 101 786 018–101 786 183, 166 basesExon 4 : 101 856 686–101 856 885, 200 basesExon 5 : 101 882 161–101 882 271, 111 basesExon 6 : 101 883 257–101 883 349, 93 basesExon 7 : 101 883 432–101 883 562, 131 basesExon 8 : 101 890 237–101 890 296, 60 basesExon 9 : 101 893 000–101 893 108, 109 basesExon 10 : 101 894 507–101 894 560, 54 basesExon 11 : 101 901 719–101 901 889, 171 basesExon 12 : 101 906 402–101 906 529, 128 basesExon 13 : 101 909 589–101 909 690, 102 basesExon 14 : 101 912 401–101 912 473, 73 basesExon 15 : 101 917 831–101 917 947, 117 basesExon 16 : 101 925 141–101 927 977, 2 837 bases151015165′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,6 kb sur les 166,3 kb du gène ; 1 740 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit PPP2R5C

3

positions dans PPP2R5C où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

1 d'entre elles (33 %) se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

Un génome entier couvre les 166,3 kb de PPP2R5C, introns compris, et pas seulement les 4,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PPP2R5C : protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ppp2r5c

Vancouver

Dante Labs. Gène PPP2R5C : protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ppp2r5c

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