Geen
TGFBR1
transforming growth factor beta receptor 1
- HGNC 11772↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000106799↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7046↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 9q22.33
- Koordinaadid
- Kromosoom 9: 99 105 113–99 154 192 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 49,1 kb
- Valk
- 503 aminohapet
- Tuntud ka kui
- ALK-5, ACVRLK4, ALK5, TBRI, TBR-i
- Varasemad tähised
- MSSE, ESS1
- MANE Select transkript
- ENST00000374994.9NM_004612.4
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tgfbr1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe TGFBR1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Aortaaneurüsm
- Familiaarne rindkere aordu aneurüsm ja dissektsioonAutosoomne dominantne
Pärilik rindkere aordu laienemine ja rebenemine, mida põhjustavad muutused geenides nagu ACTA2, MYH11, MYLK, LOX, PRKG1, MFAP5 ja THSD4.
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG sekundaarsete leidude nimekirjas
▶Tegevusvõimalikkus
Selle teadmine toetab regulaarset aordu kuvamist, vererõhu kontrolli ja õigeaegset ennetavat operatsiooni ning sugulaste sõeluuringut.
Loeys-Dietzi sündroom
- Autosoomne dominantne
Loeys-Dietzi sündroom on haruldane geneetiline sidekoehaigus, mida iseloomustab lai valik näo-koljulisi, veresoonkonna ja luustiku ilminguid; kirjeldatud on viis geneetilist alatüüpi, mis moodustavad kliinilise jätkuvuse.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG sekundaarsete leidude nimekirjas
Marfan-sarnased sündroomid
- Loeys-Dietzi sündroomAutosoomne dominantne
Loeys-Dietzi sündroom on haruldane pärilik sidekoe haigus, mida iseloomustab lai valik koljunäo-, veresoonte- ja luustikumuutusi; kirjeldatud on viis geneetilist alatüüpi, mis moodustavad kliinilise jätkuvuse.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG sekundaarsete leidude nimekirjas
Kuidas TGFBR1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6,5 kb kogupikkusega 49,1 kb; neist 1512 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: TGFBR1
99
TGFBR1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu TGFBR1 geeni 49,1 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 6,5 kb eksoneid.
Variandid, millel on leht (16)
Siin on TGFBR1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A202V | c.605C>T | Ekson 4 | 99 137 889 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A355T | c.1063G>A | Ekson 6 | 99 144 821 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| E227K | c.679G>A | Ekson 4 | 99 137 963 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| E228del | c.683_685del | Ekson 4 | 99 137 961 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| G214S | c.640G>A | Ekson 4 | 99 137 924 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| G312D | c.935G>A | Ekson 5 | 99 142 665 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| G312S | c.934G>A | Ekson 5 | 99 142 664 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| H283R | c.848A>G | Ekson 5 | 99 142 578 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| H315R | c.944A>G | Ekson 5 | 99 142 674 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| L486S | c.1457T>C | Ekson 9 | 99 149 250 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- TGFB2transforming growth factor beta 2Jagab 2 haigust
- TGFBR2transforming growth factor beta receptor 2Jagab 2 haigust
- ACTA2actin alpha 2, smooth muscleJagab 1 haigust
- FBN1fibrillin 1Jagab 1 haigust
- FOXE3forkhead box E3Jagab 1 haigust
- LOXlysyl oxidaseJagab 1 haigust
- MFAP5microfibril associated protein 5Jagab 1 haigust
- MYH11myosin heavy chain 11Jagab 1 haigust
- MYLKmyosin light chain kinaseJagab 1 haigust
- PRKG1protein kinase cGMP-dependent 1Jagab 1 haigust
- SMAD2SMAD family member 2Jagab 1 haigust
- SMAD3SMAD family member 3Jagab 1 haigust
Geeniga TGFBR1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TGFBR1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Aneurysm
- Arterial dissection
- Arterial tortuosity
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Cutis marmorata
- Mucoid extracellular matrix accumulation
- Patent ductus arteriosus
Näita veel 22 tunnust
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Abnormal left ventricular function
- Aortic regurgitation
- Ascending aortic dissection
- Descending aortic dissection
- Enlarged heart
- High blood pressure
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Pulmonary artery aneurysm
- Abdominal aortic aneurysm
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Brain aneurysm
- Carotid artery dilatation
- Depleted blood volume
- Descending thoracic aorta aneurysm
- Heart stops beating
- Ischemic stroke
- Mini stroke
- Mitral regurgitation
- Mitral valve prolapse
- Peripheral arterial stenosis
- Stroke
Abnormality of the musculoskeletal system
- Extra ribs
- Funnel chest
- Poorly developed skeletal musculature
- Abnormality of connective tissue
- Abnormality of the sternum
- Displacement of one backbone compared to another
- Double-Jointed
- Permanent flexion of the finger or toe
Näita veel 4 tunnust
Abnormality of head or neck
- Facial asymmetry
- Bifid uvula
- Little lower jaw
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Deformity of the skull
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- High palate
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TGFBR1 geen: transforming growth factor beta receptor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tgfbr1
Dante Labs. TGFBR1 geen: transforming growth factor beta receptor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tgfbr1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast