Gen
VRK1
VRK serine/threonine kinase 1
- HGNC 12718↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000100749↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 7443↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 14q32.2
- Souřadnice
- Chromozom 14: 96 797 382–96 881 609 (GRCh38)
- Exony
- 13 exonů na 84,2 kb
- Protein
- 396 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000216639.8NM_003384.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/vrk1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si VRK1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Charcot-Marie-Tooth Disease
- Distal Hereditary Motor Neuropathy
Inherited neuropathies that mainly affect motor nerves, causing weakness and wasting of the hands and feet, including SORD-related neuropathy.
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Spinal Muscular Atrophy
A group of disorders characterised by degeneration of spinal cord anterior horn cells, leading to progressive muscle weakness and atrophy.
- 5 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Gene therapy (onasemnogene abeparvovec), antisense oligonucleotide therapy (nusinersen), oral splicing modifier (risdiplam), supportive care
Širší skupiny
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- 5 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je VRK1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,7 kb z 84,2 kb genu; 1 191 těchto bází kódují protein.
Sekvenování VRK1
107
pozic v VRK1, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 84,2 kb genu VRK1, včetně intronů, nikoli jen 1,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Sdílí 3 onemocnění
- ATP7AATPase copper transporting alphaSdílí 2 onemocnění
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinSdílí 2 onemocnění
- DCTN1dynactin subunit 1Sdílí 2 onemocnění
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Sdílí 2 onemocnění
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Sdílí 2 onemocnění
- EXOSC3exosome component 3Sdílí 2 onemocnění
- EXOSC8exosome component 8Sdílí 2 onemocnění
- FBXO38F-box protein 38Sdílí 2 onemocnění
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Sdílí 2 onemocnění
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Sdílí 2 onemocnění
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 2Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s VRK1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit VRK1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Brisk reflexes
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Difficulty sleeping
- Motor axonal neuropathy
- Motor delay
- Muscle twitch
- Small cerebellum
Zobrazit ještě 26 rysů
- Absent/small cerebellum
- Decreased reflex response
- Degeneration of anterior horn cells
- Global developmental delay
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Hand tremor
- Hypoplasia of the pons
- Intellectual disability, mild
- Lateral ventricle dilatation
- Limb ataxia
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Sensory axonal neuropathy
- Simplified gyral pattern
- Babinski sign
- Cerebellar cyst
- Delayed ability to roll over
- Delayed ability to sit
- Epilepsy
- Increased reflexes
- Peripheral axonal neuropathy
- Thin corpus callosum
- Basal ganglia gliosis
- Hypoplasia of the ventral pons
- Intellectual disability
- Neuronal loss in basal ganglia
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen VRK1: VRK serine/threonine kinase 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/vrk1
Dante Labs. Gen VRK1: VRK serine/threonine kinase 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/vrk1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů