Gen
AP1S2
adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2
- HGNC 560↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000182287↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 8905↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xp22.2
- Koordinater
- Kromosom X: 15 825 806–15 854 813 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 29 kb
- Protein
- 160 aminosyror
- Även känd som
- SIGMA1B
- Tidigare symboler
- MRX59, MRXS5, PGS
- MANE Select-transkript
- ENST00000672987.1NM_001272071.2
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs AP1S2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Intellektuell funktionsnedsättning
En av 233 gener kopplade till den
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är AP1S2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,1 kb av genens 29 kb, och 483 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest AP1S2
12
positioner i AP1S2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
4 av dem (33 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (4 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 29 kb av AP1S2, med introner inräknade, inte bara de 2,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Delar 1 tillstånd
- ADKadenosine kinaseDelar 1 tillstånd
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDelar 1 tillstånd
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Delar 1 tillstånd
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Delar 1 tillstånd
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ANK3ankyrin 3Delar 1 tillstånd
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Delar 1 tillstånd
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADelar 1 tillstånd
- ARID1BAT-rich interaction domain 1BDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till AP1S2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som AP1S2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal gait
- Absent/small cerebellum
- Aggressive behavior
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- IQ between 34 and 49
- IQ less than 20
- Poor speech
Visa ytterligare 18 egenskaper
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Absent speech development
- Aqueductal stenosis
- Autism spectrum disorder
- Delayed ability to walk
- EEG abnormality
- Abnormality of the cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Delayed speech and language development
- Intellectual disability, mild
- Stereotypical hand wringing
- Choreoathetosis
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Self-injurious behavior
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Generalized decreased muscle tone
- Muscle degeneration
- Spastic diplegia
- Muscle tissue disease
- Scoliosis
- Basal ganglia calcification
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). AP1S2-genen: adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ap1s2
Dante Labs. AP1S2-genen: adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ap1s2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor