AtlasGenă
IFNG
interferon gamma
- HGNC 5438↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000111537↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 3458↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 12q15
- Coordonate
- Cromozomul 12: 68.154.768–68.159.740 (GRCh38)
- Exoni
- 4 de exoni pe 5 kb
- Proteină
- 166 de aminoacizi
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000229135.4NM_000619.3
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
AtlasAceastă pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ifng.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți IFNG și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă IFNG. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei IFNG
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 1,2 kb din cei 5 kb ai genei; 501 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea IFNG
3Scăzut
Cât de greu este de secvențiat IFNG cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale IFNG aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.4,9 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.21 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
Trăsături asociate cu IFNG
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca IFNG. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Behavioral abnormality
- Cortical dysplasia
- Cortical tubers
- Epilepsy
- Subependymal nodules
- Abnormal social behavior
- Aggressive behavior
- Autism
Afișați încă 23 de trăsături
- Autism spectrum disorder
- Depression
- Difficulty sleeping
- Epileptic spasm
- Impulsivity
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- More active than typical
- Neurodevelopmental delay
- Repeated seizures without recovery between them
- Repetitive compulsive behavior
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Specific learning disability
- Anxiety
- Attention deficit
- Noncommunicating hydrocephalus
- Poor speech
- Subependymal giant-cell astrocytoma
- Astrocytoma
- Ependymoma
- Hemimegalencephaly
- Optic nerve glioma
Abnormality of the integument
- Generalized abnormality of skin
- Hypomelanotic macule
- Confetti-like hypopigmented macules
- Shagreen patch
- Skin plaque
- Epidermoid cyst
- Subungual fibromas
- Ungual fibroma
Afișați încă 2 de trăsături
Abnormality of the genitourinary system
- Absence of renal corticomedullary differentiation
- Abnormality of the kidney
- Chronic kidney disease
- Cystic kidney disease
- Renal angiomyolipoma
- Renal failure
- Cancer starting in small tubes in kidneys
- Polycystic kidney dysplasia
Afișați încă 1 trăsătură
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena IFNG: interferon gamma. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/ifng
Dante Labs. Gena IFNG: interferon gamma [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/ifng
AtlasUn test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni