Gene
TOE1
target of EGR1, exonuclease
- HGNC 15954↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000132773↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 114034↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 1p34.1
- Coordenadas
- Cromossoma 1: 45 340 170–45 343 973 (GRCh38)
- Exões
- 8 exões ao longo de 3,8 kb
- Proteína
- 510 aminoácidos
- Também conhecido como
- hCaf1z, TOE-1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000372090.6NM_025077.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise TOE1, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Nenhum relatório do Genome Test analisa TOE1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como TOE1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 1,9 kb dos 3,8 kb do gene; 1533 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de TOE1
1Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar TOE1 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de TOE1 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.1,1%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.7,2%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
12
posições em TOE1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região difícil de analisar com leituras curtas.
Um genoma completo abrange os 3,8 kb de TOE1, incluindo os intrões, e não apenas os 1,9 kb de exões.
Características associadas a TOE1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que TOE1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Hypoplasia of the pons
- Intellectual disability
- Small brainstem
- Increased reflexes
- Abnormal cerebral morphology
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Ataxia
Mostrar mais 13 características
Abnormality of the genitourinary system
- Ambiguous external genitalia
- Undescended testes
- Short penis
- Abnormal scrotal rugation
- Absent penis
- Absent uterus
- Enlarged clitoris
- Gonadal dysgenesis
Mostrar mais 1 característica
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.17-8666dff2.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene TOE1: target of EGR1, exonuclease. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/toe1
Dante Labs. Gene TOE1: target of EGR1, exonuclease [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/toe1
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