Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

CTCF

CCCTC-binding factor

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
16q22.1
Koordinater
Kromosom 16: 67 562 526–67 639 177 (GRCh38)
Eksoner
12 eksoner over 76,7 kb
Protein
727 aminosyrer
Også kjent som
FAP108, CFAP108
MANE Select-transkripsjon
ENST00000264010.10NM_006565.4
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

    Slik er CTCF bygget opp

    • Kodende sekvens
    • Utranslatert region
    • Intron
    • Transkripsjonsretning
    • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
    • Områder som korte avlesninger sliter med
    Kromosom 16, med en parentes der CTCF står. CTCF og 49 gener i nærheten på kromosom 16, fra 67 100 852 til 68 100 851.Kromosom 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.367,2 Mb67,4 Mb67,6 Mb67,8 Mb68 MbCBFB: 67 028 984–67 101 058, fremover-strengCBFBPHAF1: 67 109 941–67 148 544, fremover-strengPHAF1B3GNT9: 67 142 023–67 151 260, bakover-strengTRADD: 67 153 969–67 163 760, bakover-strengFBXL8: 67 159 932–67 164 570, fremover-streng: 67 163 385–67 165 815, fremover-strengHSF4: 67 164 681–67 169 945, fremover-strengHSF4NOL3: 67 170 154–67 176 189, fremover-strengMATCAP1: 67 175 599–67 184 228, bakover-strengEXOC3L1: 67 184 313–67 190 242, bakover-strengE2F4: 67 192 117–67 198 919, fremover-strengE2F4ELMO3: 67 199 105–67 204 029, fremover-strengELMO3TMEM208: 67 227 103–67 229 281, fremover-strengTMEM208FHOD1: 67 229 387–67 247 539, bakover-strengFHOD1SLC9A5: 67 237 683–67 272 191, fremover-strengSLC9A5PLEKHG4: 67 277 510–67 289 499, fremover-strengPLEKHG4KCTD19: 67 289 428–67 326 766, bakover-strengKCTD19LRRC36: 67 326 798–67 385 221, fremover-strengLRRC36TPPP3: 67 389 027–67 393 518, bakover-strengTPPP3ZDHHC1: 67 394 152–67 416 833, bakover-strengZDHHC1HSD11B2: 67 430 652–67 437 553, fremover-strengHSD11B2ATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, bakover-strengATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, bakover-strengAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, fremover-strengRIPOR1CTCF: 67 562 526–67 639 177, fremover-strengCTCFCARMIL2: 67 644 988–67 657 569, fremover-strengCARMIL2ACD: 67 657 512–67 660 810, bakover-strengACDPARD6A: 67 660 350–67 664 266, fremover-strengPARD6AENKD1: 67 662 945–67 667 954, bakover-strengC16orf86: 67 666 802–67 668 757, fremover-strengGFOD2: 67 674 527–67 719 352, bakover-strengRANBP10: 67 723 070–67 806 563, bakover-strengRANBP10TSNAXIP1: 67 806 765–67 832 148, fremover-strengTSNAXIP1CENPT: 67 828 157–67 847 811, bakover-strengCENPTTHAP11: 67 842 320–67 844 195, fremover-strengTHAP11NUTF2: 67 844 369–67 872 569, fremover-strengNUTF2EDC4: 67 873 049–67 884 520, fremover-strengNRN1L: 67 884 868–67 888 855, fremover-strengPSKH1: 67 893 244–67 929 676, fremover-strengPSKH1CTRL: 67 927 640–67 932 365, bakover-strengCTRL: 67 929 614–67 936 017, bakover-strengPSMB10: 67 934 504–67 936 865, bakover-strengPSMB10LCAT: 67 939 150–67 944 681, bakover-strengSLC12A4: 67 943 474–67 969 601, bakover-strengDPEP3: 67 975 661–67 980 554, bakover-strengDPEP3DPEP2: 67 987 392–68 000 624, bakover-strengDPEP2DUS2: 67 987 746–68 079 344, fremover-strengDPEP2NB: 68 013 436–68 015 911, bakover-strengDPEP2NBDDX28: 68 020 916–68 023 232, bakover-strengDDX28NFATC3: 68 084 751–68 229 259, fremover-strengNFATC3Diagram av CTCF: 12 eksoner på fremover-strengen til kromosom 16Ekson 3: 19 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 4: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 5: 8 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 6: 13 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 7: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 8: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 9: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 11: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 1: 67 562 526–67 562 724, 199 baserEkson 2: 67 571 148–67 571 264, 117 baserEkson 3: 67 610 824–67 611 613, 790 baserEkson 4: 67 611 951–67 612 121, 171 baserEkson 5: 67 616 745–67 616 878, 134 baserEkson 6: 67 620 697–67 620 817, 121 baserEkson 7: 67 621 442–67 621 591, 150 baserEkson 8: 67 626 555–67 626 715, 161 baserEkson 9: 67 628 370–67 628 552, 183 baserEkson 10: 67 629 398–67 629 533, 136 baserEkson 11: 67 636 690–67 636 851, 162 baserEkson 12: 67 637 688–67 639 177, 1 490 baser1246810125′3′

    Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

    Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

    Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

    Eksonene utgjør 3,8 kb av genets 76,7 kb, og 2 184 av disse basene koder for proteinet.

    Slik leser en genetisk test CTCF

    57

    posisjoner i CTCF der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

    Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.

    En helgenomsekvensering dekker alle 76,7 kb av CTCF, inkludert introner, og ikke bare de 3,8 kb med eksoner.

    Hvor dette kommer fra

    • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
    • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
    • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
    • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
    • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
    • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
    • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

    Siter denne siden

    APA

    Dante Labs. (u.d.). CTCF-genet: CCCTC-binding factor. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ctcf

    Vancouver

    Dante Labs. CTCF-genet: CCCTC-binding factor [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ctcf

    Én test. En livstid med svar.

    Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

    Få mitt Genome Test