Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

CTCF

CCCTC-binding factor

Sammanfattning

Cytogenetisk position
16q22.1
Koordinater
Kromosom 16: 67 562 526–67 639 177 (GRCh38)
Exoner
12 exoner på 76,7 kb
Protein
727 aminosyror
Även känd som
FAP108, CFAP108
MANE Select-transkript
ENST00000264010.10NM_006565.4
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterad rapport som är relevant för denna gen

    Så är CTCF uppbyggd

    • Kodande sekvens
    • Otranslaterad region
    • Intron
    • Transkriptionsriktning
    • Kända sjukdomsorsakande ställen
    • Sträckor som korta läsningar har svårt för
    Kromosom 16, med en parentes där CTCF finns. CTCF och 49 gener i närheten på kromosom 16, från 67 100 852 till 68 100 851.Kromosom 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.367,2 Mb67,4 Mb67,6 Mb67,8 Mb68 MbCBFB: 67 028 984–67 101 058, framåt-strängCBFBPHAF1: 67 109 941–67 148 544, framåt-strängPHAF1B3GNT9: 67 142 023–67 151 260, bakåt-strängTRADD: 67 153 969–67 163 760, bakåt-strängFBXL8: 67 159 932–67 164 570, framåt-sträng: 67 163 385–67 165 815, framåt-strängHSF4: 67 164 681–67 169 945, framåt-strängHSF4NOL3: 67 170 154–67 176 189, framåt-strängMATCAP1: 67 175 599–67 184 228, bakåt-strängEXOC3L1: 67 184 313–67 190 242, bakåt-strängE2F4: 67 192 117–67 198 919, framåt-strängE2F4ELMO3: 67 199 105–67 204 029, framåt-strängELMO3TMEM208: 67 227 103–67 229 281, framåt-strängTMEM208FHOD1: 67 229 387–67 247 539, bakåt-strängFHOD1SLC9A5: 67 237 683–67 272 191, framåt-strängSLC9A5PLEKHG4: 67 277 510–67 289 499, framåt-strängPLEKHG4KCTD19: 67 289 428–67 326 766, bakåt-strängKCTD19LRRC36: 67 326 798–67 385 221, framåt-strängLRRC36TPPP3: 67 389 027–67 393 518, bakåt-strängTPPP3ZDHHC1: 67 394 152–67 416 833, bakåt-strängZDHHC1HSD11B2: 67 430 652–67 437 553, framåt-strängHSD11B2ATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, bakåt-strängATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, bakåt-strängAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, framåt-strängRIPOR1CTCF: 67 562 526–67 639 177, framåt-strängCTCFCARMIL2: 67 644 988–67 657 569, framåt-strängCARMIL2ACD: 67 657 512–67 660 810, bakåt-strängACDPARD6A: 67 660 350–67 664 266, framåt-strängPARD6AENKD1: 67 662 945–67 667 954, bakåt-strängC16orf86: 67 666 802–67 668 757, framåt-strängGFOD2: 67 674 527–67 719 352, bakåt-strängRANBP10: 67 723 070–67 806 563, bakåt-strängRANBP10TSNAXIP1: 67 806 765–67 832 148, framåt-strängTSNAXIP1CENPT: 67 828 157–67 847 811, bakåt-strängCENPTTHAP11: 67 842 320–67 844 195, framåt-strängTHAP11NUTF2: 67 844 369–67 872 569, framåt-strängNUTF2EDC4: 67 873 049–67 884 520, framåt-strängNRN1L: 67 884 868–67 888 855, framåt-strängPSKH1: 67 893 244–67 929 676, framåt-strängPSKH1CTRL: 67 927 640–67 932 365, bakåt-strängCTRL: 67 929 614–67 936 017, bakåt-strängPSMB10: 67 934 504–67 936 865, bakåt-strängPSMB10LCAT: 67 939 150–67 944 681, bakåt-strängSLC12A4: 67 943 474–67 969 601, bakåt-strängDPEP3: 67 975 661–67 980 554, bakåt-strängDPEP3DPEP2: 67 987 392–68 000 624, bakåt-strängDPEP2DUS2: 67 987 746–68 079 344, framåt-strängDPEP2NB: 68 013 436–68 015 911, bakåt-strängDPEP2NBDDX28: 68 020 916–68 023 232, bakåt-strängDDX28NFATC3: 68 084 751–68 229 259, framåt-strängNFATC3Diagram över CTCF: 12 exoner på framåt-strängen av kromosom 16Exon 3: 19 kända sjukdomsorsakande ställenExon 4: 4 kända sjukdomsorsakande ställenExon 5: 8 kända sjukdomsorsakande ställenExon 6: 13 kända sjukdomsorsakande ställenExon 7: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 8: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 9: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 11: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 1: 67 562 526–67 562 724, 199 baserExon 2: 67 571 148–67 571 264, 117 baserExon 3: 67 610 824–67 611 613, 790 baserExon 4: 67 611 951–67 612 121, 171 baserExon 5: 67 616 745–67 616 878, 134 baserExon 6: 67 620 697–67 620 817, 121 baserExon 7: 67 621 442–67 621 591, 150 baserExon 8: 67 626 555–67 626 715, 161 baserExon 9: 67 628 370–67 628 552, 183 baserExon 10: 67 629 398–67 629 533, 136 baserExon 11: 67 636 690–67 636 851, 162 baserExon 12: 67 637 688–67 639 177, 1 490 baser1246810125′3′

    Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

    Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

    Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

    Exoner utgör 3,8 kb av genens 76,7 kb, och 2 184 av dessa baser kodar för proteinet.

    Så läser ett genomtest CTCF

    57

    positioner i CTCF där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

    Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

    En helgenomsanalys täcker alla 76,7 kb av CTCF, med introner inräknade, inte bara de 3,8 kb exoner.

    Varifrån detta kommer

    • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
    • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
    • GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
    • ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
    • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
    • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
    • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citera den här sidan

    APA

    Dante Labs. (u.å.). CTCF-genen: CCCTC-binding factor. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ctcf

    Vancouver

    Dante Labs. CTCF-genen: CCCTC-binding factor [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ctcf

    Ett test. Ett helt liv av svar.

    Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

    Beställ mitt Genome Test