Gene
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000183765↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 11200↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 22q12.1
- Coordinate
- Cromosoma 22: 28.687.743–28.741.820 (GRCh38)
- Esoni
- 15 esoni su 54,1 kb
- Proteina
- 543 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Noto anche come
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Simboli precedenti
- RAD53
- Trascritto MANE Select
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Geni del seno e dell'ovaio oltre BRCA1/2
- Predisposizione al tumore correlata a CHEK2Autosomica dominante
Varianti in CHEK2 che aumentano moderatamente il rischio di tumore del seno e, forse, di alcuni altri tumori.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Generalmente si raccomanda uno screening mammario potenziato, spesso con risonanza magnetica annuale.
- Tumore del seno ereditarioAutosomica dominante
Suscettibilità ereditaria al tumore del seno causata da varianti in uno di diversi geni.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
A seconda del gene, può essere consigliato uno screening mammario anticipato e più intensivo, inclusa la risonanza magnetica.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
Struttura di CHEK2
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 1,8 kb dei 54,1 kb del gene; 1632 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge CHEK2
731
posizioni in CHEK2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
212 di esse (29%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Low mappability (187 siti)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma intero copre tutti i 54,1 kb di CHEK2, introni inclusi, non solo i 1,8 kb di esoni.
Varianti con una pagina (323)
Le varianti CHEK2 con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Esone 2 | 28.734.452 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| A98Pfs*12 | c.292del | Esone 2 | 28.734.429 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| c.98C>G | Esone 2 | 28.734.624 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.276del | Esone 2 | 28.734.445 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.278G>A | Esone 2 | 28.734.444 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.319+1G>A | Introne 2 | 28.734.402 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.319+1G>C | Introne 2 | 28.734.402 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.319+1G>T | Introne 2 | 28.734.402 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.319+2T>A | Introne 2 | 28.734.401 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.320-1G>T | Introne 2 | 28.725.368 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
Geni associati alle stesse condizioni
- ATMATM serine/threonine kinaseCondivide 1 condizione
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Condivide 1 condizione
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Condivide 1 condizione
- CDH1cadherin 1Condivide 1 condizione
- CTNNA1catenin alpha 1Condivide 1 condizione
- PALB2partner and localizer of BRCA2Condivide 1 condizione
Tratti collegati a CHEK2
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che CHEK2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Mostra altri 22 tratti
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene CHEK2: checkpoint kinase 2. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/chek2
Dante Labs. Gene CHEK2: checkpoint kinase 2 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/chek2
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