Gén
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000183765↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 11200↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 22q12.1
- Koordináták
- 22. kromoszóma: 28 687 743–28 741 820 (GRCh38)
- Exonok
- 15 exon, összesen 54,1 kb
- Fehérje
- 543 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális domináns
- Más néven ismert
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Korábbi jelölések
- RAD53
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a CHEK2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- CHEK2-related cancer predispositionAutoszomális domináns
Variants in CHEK2 that moderately raise the risk of breast cancer and possibly some other cancers.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Enhanced breast screening, often including annual MRI, is generally recommended.
- Hereditary breast cancerAutoszomális domináns
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
Öröklődési mód
- Autoszomális domináns
- Egy megváltozott másolat bármelyik szülőtől is származik, elegendő. Az a szülő, akinek van ilyen másolata, minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
A CHEK2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 54,1 kb-jából 1,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1632 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) CHEK2 gént
731
pozíció a(z) CHEK2 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 212 (29%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (187 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 hely)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genom a CHEK2 gén mind a 54,1 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 1,8 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (323)
Az itt található, oldallal rendelkező CHEK2 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | 2. exon | 28 734 452 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| A98Pfs*12 | c.292del | 2. exon | 28 734 429 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| c.98C>G | 2. exon | 28 734 624 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.276del | 2. exon | 28 734 445 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.278G>A | 2. exon | 28 734 444 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.319+1G>A | 2. intron | 28 734 402 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.319+1G>C | 2. intron | 28 734 402 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.319+1G>T | 2. intron | 28 734 402 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.319+2T>A | 2. intron | 28 734 401 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.320-1G>T | 2. intron | 28 725 368 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
A(z) CHEK2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CHEK2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Még 22 tulajdonság megjelenítése
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Constipation
- Malabsorption
- Primary peritoneal carcinoma
- Nausea and vomiting
- Rectal tumor
- Cancer of the pancreas
- Colon tumor
Még 6 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CHEK2 gén: checkpoint kinase 2. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/chek2
Dante Labs. CHEK2 gén: checkpoint kinase 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/chek2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt