Gen
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000183765↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 11200↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 22q12.1
- Souřadnice
- Chromozom 22: 28 687 743–28 741 820 (GRCh38)
- Exony
- 15 exonů na 54,1 kb
- Protein
- 543 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Předchozí symboly
- RAD53
- Transkript MANE Select
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CHEK2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- CHEK2-related cancer predispositionAutozomálně dominantní
Variants in CHEK2 that moderately raise the risk of breast cancer and possibly some other cancers.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Enhanced breast screening, often including annual MRI, is generally recommended.
- Hereditary breast cancerAutozomálně dominantní
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je CHEK2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,8 kb z 54,1 kb genu; 1 632 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CHEK2
731
pozic v genu CHEK2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 212 (29 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (187 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 54,1 kb genu CHEK2, včetně intronů, nikoli jen 1,8 kb exonů.
Varianty se stránkou (323)
Varianty genu CHEK2 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Exon 2 | 28 734 452 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| A98Pfs*12 | c.292del | Exon 2 | 28 734 429 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| c.98C>G | Exon 2 | 28 734 624 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.276del | Exon 2 | 28 734 445 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.278G>A | Exon 2 | 28 734 444 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.319+1G>A | Intron 2 | 28 734 402 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.319+1G>C | Intron 2 | 28 734 402 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.319+1G>T | Intron 2 | 28 734 402 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.319+2T>A | Intron 2 | 28 734 401 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.320-1G>T | Intron 2 | 28 725 368 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s CHEK2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CHEK2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Zobrazit ještě 22 rysů
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CHEK2: checkpoint kinase 2. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/chek2
Dante Labs. Gen CHEK2: checkpoint kinase 2 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/chek2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů