Gen
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000183765↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 11200↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 22q12.1
- Koordinater
- Kromosom 22: 28 687 743–28 741 820 (GRCh38)
- Exoner
- 15 exoner på 54,1 kb
- Protein
- 543 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Tidigare symboler
- RAD53
- MANE Select-transkript
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs CHEK2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Gener för bröst- och äggstockscancer utöver BRCA1/2
- Cancerpredisposition relaterad till CHEK2Autosomalt dominant
Varianter i CHEK2 som måttligt ökar risken för bröstcancer och möjligen vissa andra cancerformer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Utökad screening av brösten, ofta inklusive årlig MRT, rekommenderas i allmänhet.
- Ärftlig bröstcancerAutosomalt dominant
Ärftlig känslighet för bröstcancer orsakad av varianter i någon av flera gener.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Tidigare och mer intensiv mammografiundersökning, inklusive MRT, kan rekommenderas beroende på gen.
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är CHEK2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,8 kb av genens 54,1 kb, och 1 632 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest CHEK2
731
positioner i CHEK2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
212 av dem (29 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (187 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 ställen)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalys täcker alla 54,1 kb av CHEK2, med introner inräknade, inte bara de 1,8 kb exoner.
Varianter med egen sida (323)
De CHEK2-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Exon 2 | 28 734 452 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| A98Pfs*12 | c.292del | Exon 2 | 28 734 429 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| c.98C>G | Exon 2 | 28 734 624 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.276del | Exon 2 | 28 734 445 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.278G>A | Exon 2 | 28 734 444 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.319+1G>A | Intron 2 | 28 734 402 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.319+1G>C | Intron 2 | 28 734 402 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.319+1G>T | Intron 2 | 28 734 402 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.319+2T>A | Intron 2 | 28 734 401 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.320-1G>T | Intron 2 | 28 725 368 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till CHEK2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CHEK2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Visa ytterligare 22 egenskaper
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CHEK2-genen: checkpoint kinase 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/chek2
Dante Labs. CHEK2-genen: checkpoint kinase 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/chek2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor