Gen
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000183765↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 11200↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 22q12.1
- Koordinater
- Kromosom 22: 28 687 743–28 741 820 (GRCh38)
- Eksoner
- 15 eksoner over 54,1 kb
- Protein
- 543 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant
- Også kjent som
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Tidligere symboler
- RAD53
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les CHEK2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Gener for bryst- og eggstokkreft utover BRCA1/2
- Kreftpredisposisjon knyttet til CHEK2Autosomal dominant
Varianter i CHEK2 som moderat øker risikoen for brystkreft og muligens for enkelte andre kreftformer.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Utvidet brystkreftscreening, ofte inkludert årlig MR, anbefales som regel.
- Arvelig brystkreftAutosomal dominant
Arvelig predisposisjon for brystkreft forårsaket av varianter i ett av flere gener.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Tidligere og mer intensiv brystkreftscreening, inkludert MR, kan anbefales avhengig av genet.
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
Slik er CHEK2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,8 kb av genets 54,1 kb, og 1 632 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test CHEK2
731
posisjoner i CHEK2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
212 av dem (29 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.
- Low mappability (187 posisjoner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 posisjoner)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsekvensering dekker alle 54,1 kb av CHEK2, inkludert introner, og ikke bare de 1,8 kb med eksoner.
Varianter med egen side (323)
De CHEK2-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Ekson 2 | 28 734 452 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| A98Pfs*12 | c.292del | Ekson 2 | 28 734 429 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| c.98C>G | Ekson 2 | 28 734 624 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.276del | Ekson 2 | 28 734 445 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.278G>A | Ekson 2 | 28 734 444 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>A | Intron 2 | 28 734 402 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>C | Intron 2 | 28 734 402 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>T | Intron 2 | 28 734 402 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.319+2T>A | Intron 2 | 28 734 401 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.320-1G>T | Intron 2 | 28 725 368 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til CHEK2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CHEK2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Vis 22 egenskaper til
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). CHEK2-genet: checkpoint kinase 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/chek2
Dante Labs. CHEK2-genet: checkpoint kinase 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/chek2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker