Gène
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000183765↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 11200↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 22q12.1
- Coordonnées
- Chromosome 22 : 28 687 743–28 741 820 (GRCh38)
- Exons
- 15 exons sur 54,1 kb
- Protéine
- 543 acides aminés
- Hérédité
- Autosomique dominant
- Aussi appelé
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Symboles précédents
- RAD53
- Transcrit MANE Select
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Gènes du cancer du sein et de l'ovaire autres que BRCA1/2
- Prédisposition au cancer liée à CHEK2Autosomique dominant
Variants de CHEK2 qui augmentent modérément le risque de cancer du sein et éventuellement de certains autres cancers.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 2 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Un dépistage mammaire renforcé, incluant souvent une IRM annuelle, est généralement recommandé.
- Cancer du sein héréditaireAutosomique dominant
Prédisposition héréditaire au cancer du sein due à des variants de l'un de plusieurs gènes.
- 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Un dépistage mammaire plus précoce et plus intensif, y compris par IRM, peut être recommandé selon le gène.
Transmission
- Autosomique dominant
- Une copie modifiée, provenant de l'un ou l'autre parent, suffit. Un parent qui en porte une la transmet à chacun de ses enfants avec une probabilité de une sur deux.
Structure de CHEK2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
- Variants avec une page
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,8 kb sur les 54,1 kb du gène ; 1 632 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit CHEK2
731
positions dans CHEK2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
212 d'entre elles (29 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Low mappability (187 sites)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un génome entier couvre les 54,1 kb de CHEK2, introns compris, et pas seulement les 1,8 kb d'exons.
Variants avec une page (323)
Les variants CHEK2 disposant d'une page ici, ceux avec le plus d'étoiles de révision en premier. Chaque page décrit le dossier public de ClinVar sur le variant, jamais un résultat.
| Variant | HGVS c. | Exon ou intron | Position (GRCh38) | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Exon 2 | 28 734 452 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| A98Pfs*12 | c.292del | Exon 2 | 28 734 429 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| c.98C>G | Exon 2 | 28 734 624 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.276del | Exon 2 | 28 734 445 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.278G>A | Exon 2 | 28 734 444 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.319+1G>A | Intron 2 | 28 734 402 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.319+1G>C | Intron 2 | 28 734 402 | Probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.319+1G>T | Intron 2 | 28 734 402 | Probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.319+2T>A | Intron 2 | 28 734 401 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit | |
| c.320-1G>T | Intron 2 | 28 725 368 | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
Gènes liés aux mêmes affections
Traits associés à CHEK2
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que CHEK2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Afficher 22 traits supplémentaires
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Constipation
- Malabsorption
- Primary peritoneal carcinoma
- Nausea and vomiting
- Rectal tumor
- Cancer of the pancreas
- Colon tumor
Afficher 6 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène CHEK2 : checkpoint kinase 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/chek2
Dante Labs. Gène CHEK2 : checkpoint kinase 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/chek2
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