Gen
CHEK2
checkpoint kinase 2
- HGNC 16627↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000183765↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 11200↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 22q12.1
- Koordinater
- Kromosom 22: 28.687.743–28.741.820 (GRCh38)
- Exoner
- 15 exoner fordelt over 54,1 kb
- Protein
- 543 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Også kendt som
- CDS1, CHK2, HuCds1, PP1425, bA444G7
- Tidligere symboler
- RAD53
- MANE Select-transkript
- ENST00000404276.6NM_007194.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs CHEK2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Brystkræft- og æggestokkræftgener ud over BRCA1/2
- CHEK2-relateret kræftdispositionAutosomal dominant
Varianter i CHEK2, der moderat øger risikoen for brystkræft og muligvis for nogle andre kræftformer.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Forstærket brystscreening, ofte med årlig MR-scanning, anbefales generelt.
- Arvelig brystkræftAutosomal dominant
Arvelig disposition for brystkræft forårsaget af varianter i et af flere gener.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Tidligere og mere intensiv brystscreening, herunder MR-scanning, kan anbefales afhængigt af genet.
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er CHEK2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,8 kb af genets 54,1 kb; 1.632 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest CHEK2
731
positioner i CHEK2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
212 af dem (29 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (187 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (212 steder)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalyse dækker alle 54,1 kb af CHEK2, inklusive introner, og ikke kun de 1,8 kb eksoner.
Varianter med en side (323)
Her vises de CHEK2-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A91Cfs*17 | c.269dup | Exon 2 | 28.734.452 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| A98Pfs*12 | c.292del | Exon 2 | 28.734.429 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| c.98C>G | Exon 2 | 28.734.624 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.276del | Exon 2 | 28.734.445 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.278G>A | Exon 2 | 28.734.444 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>A | Intron 2 | 28.734.402 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>C | Intron 2 | 28.734.402 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.319+1G>T | Intron 2 | 28.734.402 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.319+2T>A | Intron 2 | 28.734.401 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.320-1G>T | Intron 2 | 28.725.368 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme sygdomme
Træk knyttet til CHEK2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CHEK2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Vis 22 træk mere
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Astrocytoma
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Choroid plexus carcinoma
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Ependymoma
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Tumors of the central nervous system
- Medulloblastoma
- Glioma
- Noncancerous growth of membranes covering brain
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CHEK2-genet: checkpoint kinase 2. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/chek2
Dante Labs. CHEK2-genet: checkpoint kinase 2 [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/chek2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger