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Gène

HERC2

HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2

Résumé

Localisation cytogénétique
15q13.1
Coordonnées
Chromosome 15 : 28 111 040–28 322 179 (GRCh38)
Exons
93 exons sur 211,1 kb
Protéine
4 834 acides aminés
Aussi appelé
jdf2, p528, D15F37S1
Transcrit MANE Select
ENST00000261609.13NM_004667.6
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HERC2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HERC2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de HERC2. HERC2 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 27 716 610 à 28 716 609.Chromosome 1515q13.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.327,8 Mb28 Mb28,2 Mb28,4 Mb28,6 MbOCA2 : 27 754 859–28 099 664, brin inverseOCA2HERC2 : 28 111 040–28 322 179, brin inverseHERC2GOLGA6L24 : 28 347 851–28 358 084, brin inverseGOLGA6L24GOLGA8F : 28 378 621–28 392 021, brin directGOLGA8FGOLGA8G : 28 519 611–28 533 014, brin inverseGOLGA8GGOLGA6L25 : 28 553 568–28 563 779, brin directGOLGA6L25GOLGA8M : 28 698 583–28 738 384, brin inverseGOLGA8MSchéma de HERC2 : 93 exons sur le brin inverse du chromosome 15Exon 92 : 1 site connu associé à une maladieExon 87 : 1 site connu associé à une maladieExon 84 : 1 site connu associé à une maladieExon 83 : 1 site connu associé à une maladieExon 80 : 1 site connu associé à une maladieExon 78 : 1 site connu associé à une maladieExon 64 : 1 site connu associé à une maladieExon 49 : 1 site connu associé à une maladieExon 48 : 1 site connu associé à une maladieExon 27 : 1 site connu associé à une maladieExon 22 : 1 site connu associé à une maladieExon 19 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 93 : 28 111 040–28 112 035, 996 basesExon 92 : 28 113 071–28 113 283, 213 basesExon 91 : 28 113 573–28 113 678, 106 basesExon 90 : 28 114 612–28 114 802, 191 basesExon 89 : 28 115 429–28 115 541, 113 basesExon 88 : 28 116 665–28 116 859, 195 basesExon 87 : 28 117 013–28 117 154, 142 basesExon 86 : 28 121 346–28 121 429, 84 basesExon 85 : 28 124 037–28 124 234, 198 basesExon 84 : 28 125 006–28 125 193, 188 basesExon 83 : 28 130 163–28 130 302, 140 basesExon 82 : 28 130 503–28 130 594, 92 basesExon 81 : 28 132 100–28 132 261, 162 basesExon 80 : 28 132 653–28 132 830, 178 basesExon 79 : 28 135 478–28 135 692, 215 basesExon 78 : 28 141 432–28 141 630, 199 basesExon 77 : 28 141 731–28 141 846, 116 basesExon 76 : 28 142 238–28 142 393, 156 basesExon 75 : 28 142 827–28 142 952, 126 basesExon 74 : 28 143 873–28 143 991, 119 basesExon 73 : 28 144 077–28 144 235, 159 basesExon 72 : 28 144 673–28 144 804, 132 basesExon 71 : 28 146 237–28 146 344, 108 basesExon 70 : 28 152 677–28 152 830, 154 basesExon 69 : 28 163 094–28 163 285, 192 basesExon 68 : 28 167 687–28 167 827, 141 basesExon 67 : 28 168 407–28 168 590, 184 basesExon 66 : 28 169 484–28 169 655, 172 basesExon 65 : 28 174 395–28 174 620, 226 basesExon 64 : 28 175 512–28 175 656, 145 basesExon 63 : 28 176 428–28 176 599, 172 basesExon 62 : 28 176 687–28 176 768, 82 basesExon 61 : 28 176 950–28 177 127, 178 basesExon 60 : 28 177 419–28 177 509, 91 basesExon 59 : 28 178 887–28 179 030, 144 basesExon 58 : 28 179 142–28 179 223, 82 basesExon 57 : 28 182 401–28 182 512, 112 basesExon 56 : 28 186 577–28 186 752, 176 basesExon 55 : 28 190 965–28 191 056, 92 basesExon 54 : 28 191 139–28 191 244, 106 basesExon 53 : 28 191 961–28 192 151, 191 basesExon 52 : 28 196 215–28 196 354, 140 basesExon 51 : 28 196 461–28 196 569, 109 basesExon 50 : 28 198 378–28 198 503, 126 basesExon 49 : 28 198 601–28 198 769, 169 basesExon 48 : 28 201 456–28 201 554, 99 basesExon 47 : 28 202 113–28 202 249, 137 basesExon 46 : 28 202 347–28 202 614, 268 basesExon 45 : 28 206 240–28 206 382, 143 basesExon 44 : 28 211 002–28 211 145, 144 basesExon 43 : 28 212 445–28 212 583, 139 basesExon 42 : 28 213 742–28 213 972, 231 basesExon 41 : 28 214 076–28 214 272, 197 basesExon 40 : 28 214 655–28 214 802, 148 basesExon 39 : 28 215 621–28 215 802, 182 basesExon 38 : 28 218 489–28 218 671, 183 basesExon 37 : 28 220 452–28 220 644, 193 basesExon 36 : 28 222 028–28 222 215, 188 basesExon 35 : 28 228 218–28 228 409, 192 basesExon 34 : 28 229 195–28 229 346, 152 basesExon 33 : 28 229 460–28 229 596, 137 basesExon 32 : 28 229 674–28 229 847, 174 basesExon 31 : 28 230 367–28 230 500, 134 basesExon 30 : 28 233 146–28 233 341, 196 basesExon 29 : 28 233 434–28 233 561, 128 basesExon 28 : 28 233 664–28 233 796, 133 basesExon 27 : 28 234 070–28 234 284, 215 basesExon 26 : 28 236 963–28 237 113, 151 basesExon 25 : 28 238 114–28 238 217, 104 basesExon 24 : 28 238 602–28 238 772, 171 basesExon 23 : 28 245 881–28 246 066, 186 basesExon 22 : 28 246 742–28 246 897, 156 basesExon 21 : 28 248 552–28 248 736, 185 basesExon 20 : 28 254 340–28 254 518, 179 basesExon 19 : 28 255 872–28 255 996, 125 basesExon 18 : 28 256 089–28 256 317, 229 basesExon 17 : 28 257 061–28 257 261, 201 basesExon 16 : 28 260 777–28 260 970, 194 basesExon 15 : 28 262 918–28 263 169, 252 basesExon 14 : 28 265 618–28 265 731, 114 basesExon 13 : 28 265 817–28 265 974, 158 basesExon 12 : 28 268 465–28 268 616, 152 basesExon 11 : 28 269 248–28 269 436, 189 basesExon 10 : 28 270 695–28 270 868, 174 basesExon 9 : 28 272 215–28 272 386, 172 basesExon 8 : 28 272 894–28 273 004, 111 basesExon 7 : 28 274 291–28 274 447, 157 basesExon 6 : 28 274 905–28 275 005, 101 basesExon 5 : 28 280 068–28 280 287, 220 basesExon 4 : 28 292 888–28 293 022, 135 basesExon 3 : 28 299 402–28 299 516, 115 basesExon 2 : 28 321 362–28 321 464, 103 basesExon 1 : 28 322 075–28 322 179, 105 bases938060402015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 15,4 kb sur les 211,1 kb du gène ; 14 505 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HERC2

16

positions dans HERC2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

7 d'entre elles (44 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (7 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un génome entier couvre les 211,1 kb de HERC2, introns compris, et pas seulement les 15,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HERC2 : HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/herc2

Vancouver

Dante Labs. Gène HERC2 : HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/herc2

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