Gène
FASLG
Fas ligand
- HGNC 11936↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000117560↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 356↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 1q24.3
- Coordonnées
- Chromosome 1 : 172 659 103–172 666 876 (GRCh38)
- Exons
- 4 exons sur 7,8 kb
- Protéine
- 281 acides aminés
- Aussi appelé
- APTL, CD95L, FasL, CD178
- Symboles précédents
- APT1LG1, TNFSF6
- Transcrit MANE Select
- ENST00000367721.3NM_000639.3
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Cette page en données
Ajoutez .json à l'adresse de la page, ou demandez application/json, pour la lire au format JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/faslg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLisez FASLG, et le reste de votre génome, avec un seul test.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines
Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Maladie auto-immune
Affection résultant d'une perte de fonction ou de la destruction tissulaire d'un ou de plusieurs organes, provoquée par des réponses immunitaires humorales ou cellulaires de l'organisme dirigées contre ses propres constituants tissulaires. Elle peut être systémique (par exemple, le lupus érythémateux disséminé) ou spécifique d'un organe (par exemple, la thyroïdite).
- ClinGen juge le lien définitif
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Syndrome lymphoprolifératif autoimmun (ALPS)
- Syndrome lymphoprolifératif autoimmun
Élargissement chronique des ganglions lymphatiques et de la rate, cytopénies auto-immunes et augmentation des lymphocytes T double négatifs, causés par des modifications de FAS, FASLG, CASP10 et d'autres gènes de l'apoptose.
- ClinGen juge le lien définitif
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Le diagnostic permet d'envisager le sirolimus ou une autre immunosuppression pour les cytopénies, d'éviter une splénectomie inutile, de surveiller le risque de lymphome et de proposer un dépistage aux membres de la famille.
Regroupements plus larges
Autres erreurs innées de l'immunité
- Erreur innée de l'immunité
L'un des 114 gènes qui lui sont liés
Maladies héréditaires du système immunitaire causées par des modifications de gènes uniques, qui affectent la manière dont l'organisme combat les infections ou régule l'inflammation.
- ClinGen juge le lien définitif
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Structure de FASLG
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,8 kb sur les 7,8 kb du gène ; 846 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de FASLG
4Facile
Difficulté de séquençage de FASLG avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de FASLG se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.
Facteur aggravant : la part des exons de FASLG située dans chaque type de région difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel dans ces zones peut être manquant ou erroné. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 100.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Partagé avec le chrYLes régions pseudoautosomales et la région transposée du X, où les chrX et chrY portent la même séquence ou une séquence presque identique, si bien qu'une lecture issue de l'un peut être placée sur l'autre. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Couverture de la référenceLacunes dans l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 50.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et suites d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir en entier. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 30.8,1 %
- Teneur en GCFenêtres comportant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 20.7,4 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de FASLG située dans ce type de région difficile. Chaque type peut à lui seul rendre un gène difficile, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans l'un d'eux, 100 lorsque toutes les bases se trouvent dans des zones où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
5
positions dans FASLG où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se trouve dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 7,8 kb de FASLG dans leur totalité, introns compris, et pas seulement les 1,8 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (5)
The FASLG variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 3
- Probablement pathogène 2
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_000639.3(FASLG):c.44del (p.Val15fs) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000639.3(FASLG):c.343C>T (p.Arg115Ter) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000639.3(FASLG):c.605G>C (p.Cys202Ser) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000639.3(FASLG):c.739del (p.Ala247fs) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_000639.3(FASLG):c.829G>A (p.Gly277Ser) (opens in a new tab) | lung cancer | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
Gènes liés aux mêmes affections
- CASP10caspase 10Partage 3 affections
- CASP8caspase 8Partage 3 affections
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Partage 3 affections
- FASFas cell surface death receptorPartage 3 affections
- KRASKRas proto-oncogene, GTPasePartage 3 affections
- PRKCDprotein kinase C deltaPartage 3 affections
- C1QAcomplement C1q A chainPartage 2 affections
- STAT1signal transducer and activator of transcription 1Partage 2 affections
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Partage 2 affections
- TREX1three prime repair exonuclease 1Partage 2 affections
- ADARadenosine deaminase RNA specificPartage 1 affection
- AICDAactivation induced cytidine deaminasePartage 1 affection
Traits associés à FASLG
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que FASLG peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune neutropenia
- Autoimmune thrombocytopenia
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Increased double-negative T cell number
- Increased total B cell count
- Abnormal CD4+ T cell subset proportion
Afficher 16 traits supplémentaires
- Abnormal total CD8+ T cell number
- B-cell lymphoma
- Burkitt lymphoma
- Coombs-positive hemolytic anemia
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased total CD4+ T cell proportion
- High blood eosinophil count
- High lymphocyte count
- Hodgkin lymphoma
- Increased immature red blood cells
- Non-Hodgkin lymphoma
- T-cell lymphoma
- Bone marrow failure
- Bone marrow hypercellularity
- Increased HLA-DR+ CD4+ T cell proportion
- Iron deficiency anemia
Abnormality of the immune system
- Autoimmunity
- Abnormal circulating interleukin concentration
- Increased circulating interleukin 10 concentration
- Antineutrophil antibody positivity
- Antinuclear antibody positivity
- Antiphospholipid antibody positivity
- Decreased specific anti-polysaccharide antibody concentration
- Increased circulating interleukin 18 concentration
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal T cell apoptosis
- Increased antibody level in blood
- Increased circulating IgG concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Decreased circulating IgM concentration
- Increased circulating IgA concentration
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased T cell apoptosis
Afficher 2 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène FASLG : Fas ligand. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/faslg
Dante Labs. Gène FASLG : Fas ligand [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/faslg
Un seul test. Des réponses pour toute la vie.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines