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Gène

TNFSF4

TNF superfamily member 4

Résumé

Localisation cytogénétique
1q25.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 173 183 731–173 207 331 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 23,6 kb
Protéine
183 acides aminés
Aussi appelé
OX-40L, gp34, CD252
Symboles précédents
TXGP1
Transcrit MANE Select
ENST00000281834.4NM_003326.5
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TNFSF4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TNFSF4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de TNFSF4. TNFSF4 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 172 695 531 à 173 695 530.Chromosome 11q25.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44172,8 Mb173 Mb173,2 Mb173,4 Mb173,6 MbTNFSF18 : 173 039 202–173 050 941, brin inverseTNFSF18TNFSF4 : 173 183 731–173 207 331, brin inverseTNFSF4PRDX6 : 173 476 814–173 494 013, brin directPRDX6SLC9C2 : 173 500 460–173 603 077, brin inverseSLC9C2 : 173 596 060–173 669 837, brin inverseANKRD45 : 173 606 033–173 669 868, brin inverseANKRD45TEX50 : 173 635 338–173 637 130, brin directTEX50Schéma de TNFSF4 : 3 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 3 : 173 183 731–173 186 865, 3 135 basesExon 2 : 173 188 521–173 188 569, 49 basesExon 1 : 173 207 024–173 207 331, 308 bases3215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,5 kb sur les 23,6 kb du gène ; 552 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TNFSF4

1Facile

Difficulté de séquençage de TNFSF4 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de TNFSF4 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de TNFSF4 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions5 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Traits associés à TNFSF4

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TNFSF4 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TNFSF4 : TNF superfamily member 4. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tnfsf4

Vancouver

Dante Labs. Gène TNFSF4 : TNF superfamily member 4 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tnfsf4

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