Gen
FASLG
Fas ligand
- HGNC 11936↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000117560↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 356↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1q24.3
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 172.659.103–172.666.876 (GRCh38)
- Exons
- 4 exons over 7,8 kb
- Eiwit
- 281 aminozuren
- Ook bekend als
- APTL, CD95L, FasL, CD178
- Eerdere symbolen
- APT1LG1, TNFSF6
- MANE Select-transcript
- ENST00000367721.3NM_000639.3
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/faslg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees FASLG en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Autoimmuunziekte
Een aandoening die het gevolg is van verlies van functie of weefselafbraak van een orgaan of meerdere organen, veroorzaakt door humorale of cellulaire immuunreacties van het lichaam tegen zijn eigen weefselbestanddelen. Ze kan systemisch zijn (bijv. systemische lupus erythematodes) of orgaanspecifiek (bijv. thyreoïditis).
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Autoimmuun lymfoproliferatief syndroom (ALPS)
- Autoimmuun lymfoproliferatief syndroom
Chronische vergroting van lymfeklieren en milt, autoimmuun cytopenieën en verhoogde aantallen dubbel-negatieve T-cellen, veroorzaakt door veranderingen in FAS, FASLG, CASP10 en verwante apoptosegenen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Een diagnose maakt het mogelijk om sirolimus of andere immunosuppressie toe te passen bij cytopenieën, onnodige splenectomie te vermijden, alert te zijn op lymfoom en familieleden te laten testen.
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Aangeboren immuundeficiëntie
Een van 114 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen van het immuunsysteem die worden veroorzaakt door veranderingen in één gen en die invloed hebben op hoe het lichaam infecties bestrijdt of ontstekingen reguleert.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van FASLG
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,8 kb van de 7,8 kb van het gen; 846 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing FASLG
4Makkelijk
Hoe moeilijk FASLG is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van FASLG liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.
Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van FASLG in elk soort moeilijke regio
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, zodat een call daar mogelijk ontbreekt of fout is. Gewicht 100%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Gewicht 60%.0%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 50%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die mogelijk niet volledig worden overspannen. Gewicht 30%.8,1%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die de bibliotheekbereiding dun dekt. Gewicht 20%.7,4%
Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekendElke balk is het aandeel van de exonbasen van FASLG in dat soort moeilijke regio. Elk soort kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra soort voegt steeds minder toe: 0 als geen enkele base in een regio ligt, 100 als elke base op een plek ligt waar reads niet uniek kunnen worden geplaatst.
5
posities in FASLG waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 7,8 kb van FASLG, inclusief intronen, en niet alleen de 1,8 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (5)
The FASLG variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 3
- Waarschijnlijk pathogeen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000639.3(FASLG):c.44del (p.Val15fs) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_000639.3(FASLG):c.343C>T (p.Arg115Ter) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_000639.3(FASLG):c.605G>C (p.Cys202Ser) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_000639.3(FASLG):c.739del (p.Ala247fs) (opens in a new tab) | autoimmune lymphoproliferative syndrome type 1 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_000639.3(FASLG):c.829G>A (p.Gly277Ser) (opens in a new tab) | lung cancer | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CASP10caspase 10Deelt 3 aandoeningen
- CASP8caspase 8Deelt 3 aandoeningen
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Deelt 3 aandoeningen
- FASFas cell surface death receptorDeelt 3 aandoeningen
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseDeelt 3 aandoeningen
- PRKCDprotein kinase C deltaDeelt 3 aandoeningen
- C1QAcomplement C1q A chainDeelt 2 aandoeningen
- STAT1signal transducer and activator of transcription 1Deelt 2 aandoeningen
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Deelt 2 aandoeningen
- TREX1three prime repair exonuclease 1Deelt 2 aandoeningen
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeelt 1 aandoening
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan FASLG
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die FASLG kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Autoimmune hemolytic anemia
- Autoimmune neutropenia
- Autoimmune thrombocytopenia
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Increased double-negative T cell number
- Increased total B cell count
- Abnormal CD4+ T cell subset proportion
Toon 16 kenmerken meer
- Abnormal total CD8+ T cell number
- B-cell lymphoma
- Burkitt lymphoma
- Coombs-positive hemolytic anemia
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased total CD4+ T cell proportion
- High blood eosinophil count
- High lymphocyte count
- Hodgkin lymphoma
- Increased immature red blood cells
- Non-Hodgkin lymphoma
- T-cell lymphoma
- Bone marrow failure
- Bone marrow hypercellularity
- Increased HLA-DR+ CD4+ T cell proportion
- Iron deficiency anemia
Abnormality of the immune system
- Autoimmunity
- Abnormal circulating interleukin concentration
- Increased circulating interleukin 10 concentration
- Antineutrophil antibody positivity
- Antinuclear antibody positivity
- Antiphospholipid antibody positivity
- Decreased specific anti-polysaccharide antibody concentration
- Increased circulating interleukin 18 concentration
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal T cell apoptosis
- Increased antibody level in blood
- Increased circulating IgG concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Decreased circulating IgM concentration
- Increased circulating IgA concentration
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased T cell apoptosis
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-19: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.19-9814e911.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). FASLG-gen: Fas ligand. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/faslg
Dante Labs. FASLG-gen: Fas ligand [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/faslg
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken