Geeni
RNASEH2C
ribonuclease H2 subunit C
- HGNC 24116↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000172922↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 84153↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 11q13.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 11: 65 717 673–65 720 798 (GRCh38)
- Eksonit
- 4 eksonia 3,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 164 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- AYP1, AGS3
- MANE Select -transkripti
- ENST00000308418.10NM_032193.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnaseh2c.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue RNASEH2C ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Aicardi-Goutières-oireyhtymä
- RNASEH2C-liittyvä tyypin 1 interferonopatiaAutosomaalinen resessiivinen
RNASEH2C-variantit, jotka aiheuttavat Aicardi-Goutières-oireyhtymän.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
- Autosomaalinen resessiivinen
Aicardi-Goutières-oireyhtymä (AGS) on perinnöllinen, subakuutisti etenevä enkefalopatia, jolle ovat ominaisia tyvitumakkeiden kalkkeutuma, leukodystrofia ja aivo-selkäydinnesteen lymfosytoosi.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Harvinaiset yksigeeniset autoinflammatoriset sairaudet
- PTPN2-geeniin liittyvä autoinflammaatio ja autoimmuniteettiAutosomaalinen dominantti
Varhain alkava tulehduksellinen ja autoimmuunisairaus, johon kuuluvat mm. paksusuolitulehdus ja niveltulehdus. Aiheuttajana ovat PTPN2-geenin variantit.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Perinnöllinen immuunipuutos
Yksi 114 siihen liittyvästä geenistä
Immuunijärjestelmän perinnölliset häiriöt, joita aiheuttavat yksittäisten geenien muutokset ja jotka vaikuttavat siihen, miten elimistö torjuu infektioita tai säätelee tulehdusta.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Muut perinnölliset leukodystrofiat
- Leukodystrofia (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 80 siihen liittyvästä geenistä
Perinnölliset sairaudet, jotka vahingoittavat myeliinituppea eli aivojen ja selkäytimen valkeaa ainetta tai estävät sen normaalin muodostumisen. Eri tyypit periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, autosomaalisesti dominantisti tai X-kromosomaalisesti sen mukaan, mikä geeni on kyseessä.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Toimenpidettävyys
Tiedossa oleva geneettinen syy voi lopettaa diagnoosin etsimisen, ohjata tukihoitoa ja seurantaa, osoittaa, onko olemassa tiettyä hoitoa, sekä mahdollistaa sukulaisten testauksen.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
RNASEH2C-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 3,1 kb:stä; 495 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: RNASEH2C
7
RNASEH2C-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 3,1 kb geenistä RNASEH2C, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 2,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADARadenosine deaminase RNA specificYhteisiä sairauksia: 4
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Yhteisiä sairauksia: 4
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit AYhteisiä sairauksia: 4
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BYhteisiä sairauksia: 4
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Yhteisiä sairauksia: 4
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Yhteisiä sairauksia: 4
- TREX1three prime repair exonuclease 1Yhteisiä sairauksia: 4
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexYhteisiä sairauksia: 2
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexYhteisiä sairauksia: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin RNASEH2C liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RNASEH2C voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- Global developmental delay
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Brain degeneration
Näytä 21 piirrettä lisää
- Chronic CSF lymphocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Abnormal cerebral white matter morphology
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Delayed myelination
- Encephalopathy
- Increased reflexes
- Severe global developmental delay
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RNASEH2C-geeni: ribonuclease H2 subunit C. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rnaseh2c
Dante Labs. RNASEH2C-geeni: ribonuclease H2 subunit C [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rnaseh2c
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa