Geen
FBXL4
F-box and leucine rich repeat protein 4
- HGNC 13601↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000112234↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 26235↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 6q16.1-q16.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 6: 98 868 535–98 947 946 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 79,4 kb
- Valk
- 621 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FBL4, FBL5
- MANE Select transkript
- ENST00000369244.7NM_001278716.2
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fbxl4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe FBXL4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Primaarne mitokondriaalne haigus
- Mitokondriaalse DNA kadu sündroom
Põhjustavad tuumageenide, näiteks POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B ja SUCLA2 variandid, mis vähendavad mitokondriaalse DNA hulka ning võivad põhjustada lihaste, maksa või aju haigusi.
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Teadmine on otseselt kasutatav: POLG-haiguse korral tuleb valproaati vältida surmaga lõppeva maksapuudulikkuse riski tõttu ning TK2 puudulikkuse korral on olemas nukleosiidravi.
Laiemad rühmad
Leigh'i sündroom
Üks 69 sellega seotud geenist
Progresseeruv neuroloogiline haigus, mida iseloomustavad spetsiifilised neuropatoloogilised tunnused, mis seovad ajutüve ja basaalganglionide kahjustused.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Harvinaised pärilikud perifeersed neuropaatiad
- Pärilik perifeerne neuropaatia
Üks 233 sellega seotud geenist
Põhjustatud muutustest ühes paljudest geenidest, mis on vajalikud pikkade närvikiudude tervena hoidmiseks. Käesolevas raportis hõlmavad need geene IGHMBP2 ja PLEKHG5, mis on retsessiivsed.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Füsioteraapia, ortoosid ja tegevusteraapia aitavad säilitada liikumisvõimet, vajadusel tehakse jaladeformatsioonide korral operatsioon. Mõnel vormil on vaja jälgida hingamist. Geneetiline nõustamine juhendab sugulaste testimist vastavalt asjaomase geeni pärimistüübile.
Kuidas FBXL4 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 8,1 kb kogupikkusega 79,4 kb; neist 1866 alust kodeerivad valku.
FBXL4 sekveneerimine
72
positsioonid geenis FBXL4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti tabavad.
Terve genoom katab kogu geeni FBXL4 79,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksonite 8,1 kb.
ClinVar pathogenic variants (74)
The FBXL4 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeenne 24
- Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne 8
- Tõenäoliselt patogeenne 42
| Variant | Conditions | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1648_1649del (p.Asp550fs) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1641_1642del (p.Cys547_Asp548delinsTer) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1303C>T (p.Arg435Ter) (opens in a new tab) | Leigh syndrome and 2 others | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1067del (p.Gly356fs) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.316C>T (p.Gln106Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.219T>A (p.Tyr73Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.141del (p.Asn48fs) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1790A>C (p.Gln597Pro) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1703G>C (p.Gly568Ala) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1698A>G (p.Ile566Met) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1444C>T (p.Arg482Trp) (opens in a new tab) | Leigh syndrome and 1 other | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1288C>T (p.Arg430Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.616C>T (p.Arg206Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.292C>T (p.Arg98Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.64C>T (p.Arg22Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1540T>G (p.Trp514Gly) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1304G>T (p.Arg435Leu) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1232G>A (p.Cys411Tyr) (opens in a new tab) | Leigh syndrome and 1 other | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.826_842del (p.Pro275_Asn276insTer) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.419T>C (p.Val140Ala) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1687C>T (p.Gln563Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1440dup (p.Leu481fs) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1389+3_1389+6del (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1317G>A (p.Glu439=) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_001278716.2(FBXL4):c.1210C>T (p.Gln404Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 13 | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
See all 74 with every other FBXL4 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Samade haigustega seotud geenid
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPaseJagab 3 haigust
- SUCLA2succinate-CoA ligase ADP-forming subunit betaJagab 3 haigust
- SUCLG1succinate-CoA ligase GDP/ADP-forming subunit alphaJagab 3 haigust
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Jagab 2 haigust
- ATP5MKATP synthase membrane subunit kJagab 2 haigust
- BTDbiotinidaseJagab 2 haigust
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Jagab 2 haigust
- DLATdihydrolipoamide S-acetyltransferaseJagab 2 haigust
- DLDdihydrolipoamide dehydrogenaseJagab 2 haigust
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 2 haigust
- ECHS1enoyl-CoA hydratase, short chain 1Jagab 2 haigust
- ETHE1ETHE1 persulfide dioxygenaseJagab 2 haigust
Geeniga FBXL4 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida FBXL4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Babinski sign
- CNS hypomyelination
- Encephalopathy
- Generalized brain degeneration
- Hyperactive movements
- Increased reflexes
- Leukodystrophy
- More grooves in brain
Näita veel 19 tunnust
- Small cerebellum
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Global developmental delay
- Degeneration of cerebrum
- Elevated brain lactate level by MRS
- Epilepsy
- Ventriculomegaly
- Ataxia
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed CNS myelination
- Dystonia
- Focal impaired awareness seizure
- Periventricular cysts
- Thin corpus callosum
- Infantile spasms
- Severe global developmental delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of the cardiovascular system
- Patent ductus arteriosus
- Abnormal heart rate
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Enlarged and thickened heart muscle
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Left ventricular hypertrophy
- Patent foramen ovale
- Right ventricular hypertrophy
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-18: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.18-8b139e39.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). FBXL4 geen: F-box and leucine rich repeat protein 4. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/fbxl4
Dante Labs. FBXL4 geen: F-box and leucine rich repeat protein 4 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/fbxl4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast