Geen
ATP7B
ATPase copper transporting beta
- HGNC 870↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000123191↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 540↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 13q14.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 13: 51 932 669–52 011 450 (GRCh38)
- Eksonid
- 21 eksonit, ulatus 78,8 kb
- Valk
- 1465 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Varasemad tähised
- WND
- MANE Select transkript
- ENST00000242839.10NM_000053.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe ATP7B ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Vase ainevahetuse häire
Pärilik ainevahetushaigus, mis põhineb rakusisese vaskioonide homeostaasi häiritusel.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Wilsonova tõbi
- Autosoomne retsessiivne
Väga harv pärilik multisüsteemne haigus, mis avaldub ebaspetsiifiliste neroloogiliste, maksa-, psühhiaatriliste või luu-lihaskonna sümptomitega organismi liigse vasevarude tõttu.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Vasekelaatravi, tsinkatsetaat, vaba vasest toitumispiirang, maksasiirdamine fulminantse maksapuudulikkuse korral
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas ATP7B on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6,6 kb kogupikkusega 78,8 kb; neist 4398 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ATP7B
730
kohad geenis ATP7B, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ATP7B 78,8 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (6,6 kb).
Variandid, millel on leht (396)
Siin on ATP7B variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A32Sfs*9 | c.92dup | Ekson 2 | 51 975 127 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A38Cfs*3 | c.111dup | Ekson 2 | 51 975 108 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A98Cfs*65 | c.291dup | Ekson 2 | 51 974 928 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A399Lfs*2 | c.1195_1205del | Ekson 2 | 51 974 014 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A629Vfs*19 | c.1886del | Ekson 6 | 51 961 896 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A803T | c.2407G>A | Ekson 9 | 51 957 556 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A1003V | c.3008C>T | Ekson 13 | 51 946 336 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A1063G | c.3188C>G | Ekson 14 | 51 944 164 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A1074T | c.3220G>A | Ekson 14 | 51 944 132 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A1135Qfs*13 | c.3402del | Ekson 15 | 51 942 395 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
Geeniga ATP7B seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ATP7B võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Decreased muscle movement
- Decreased nerve conduction velocity
- Face of the giant panda sign
- Hand tremor
- Limb dystonia
- Parkinsonism with favorable response to dopaminergic medication
- Tremor
Näita veel 22 tunnust
- Aggressive behavior
- Amplification of sexual behavior
- Clumsiness
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Chorea
- Difficulty staying or falling asleep
- Dystonia
- Numbness
- Personality changes
- Anxiety
- Epilepsy
- Focal T2 hyperintense brainstem lesion
- Hallucinations
- Peripheral nerve disease
- Psychosis
- Coma
- Dementia
- Incoordination
- Mixed demyelinating and axonal polyneuropathy
Laboratory abnormality
- Decreased serum ceruloplasmin
- Elevated circulating copper concentration
- Fatty infiltration of liver
- Fluid retention
- High blood bilirubin levels
- High nonceruloplasmin-bound serum copper
- Increased urinary copper concentration
- Low albumin
Näita veel 10 tunnust
- Low blood uric acid levels
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- High liver enzymes
- Joint swelling
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Elevated urine calcium levels
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
Abnormality of the musculoskeletal system
- Rigidity
- Arthritis
- Back pain
- Bone pain
- Spontaneous fracture
- Osteoporosis
- Calcium deposits in joints
- Degenerative joint disease
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ATP7B geen: ATPase copper transporting beta. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/atp7b
Dante Labs. ATP7B geen: ATPase copper transporting beta [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/atp7b
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast