Geen
ARPC5
actin related protein 2/3 complex subunit 5
- HGNC 708↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000162704↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 10092↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1q25.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 183 620 846–183 635 783 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 14,9 kb
- Valk
- 151 aminohapet
- Tuntud ka kui
- p16-Arc, ARC16, dJ127C7.3
- MANE Select transkript
- ENST00000359856.11NM_005717.4
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/arpc5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe ARPC5 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Immuunpuudulikkushaigus
Üks 170 sellega seotud geenist
Haigus, mille korral on rakulise või humoraalse immuunsuse mehhanismid puudulikud või defektsed.
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
HSCT raske kombineeritud immuunpuudulikkuse (SCID) ja muude raskete PID-ide korral; immunoglobuliini asendusravi (IVIG/SCIG) antikehade puudulikkuse korral; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-i korral; geenravi ADA-SCID-i korral; abatatsept CTLA4/LRBA puudulikkuse korral; profülaktilised antibiootikumid; G-CSF CGD korral
Kuidas ARPC5 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 7,3 kb kogupikkusega 14,9 kb; neist 456 alust kodeerivad valku.
ARPC5 sekventeerimine
3Madal
Kui raske on ARPC5 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa ARPC5 eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.5,7%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.4,4%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.6,8%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
Samade haigustega seotud geenid
- ADAadenosine deaminaseJagab 1 haigust
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseJagab 1 haigust
- AK2adenylate kinase 2Jagab 1 haigust
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BJagab 1 haigust
- ATMATM serine/threonine kinaseJagab 1 haigust
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Jagab 1 haigust
- B2Mbeta-2-microglobulinJagab 1 haigust
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Jagab 1 haigust
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorJagab 1 haigust
- BCL11BBCL11 transcription factor BJagab 1 haigust
- BLNKB cell linkerJagab 1 haigust
- BTKBruton tyrosine kinaseJagab 1 haigust
Geeniga ARPC5 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ARPC5 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-17: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ARPC5 geen: actin related protein 2/3 complex subunit 5. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/arpc5
Dante Labs. ARPC5 geen: actin related protein 2/3 complex subunit 5 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/arpc5
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast