Gen
CFB
complement factor B
- HGNC 1037↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000243649↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 629↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 6p21.33
- Souřadnice
- Chromozom 6: 31 946 095–31 952 084 (GRCh38)
- Exony
- 18 exonů na 6 kb
- Protein
- 764 aminokyselin
- Další názvy
- H2-Bf
- Předchozí symboly
- BFD, BF
- Transkript MANE Select
- ENST00000425368.7NM_001710.6
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cfb.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si CFB i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hemolytic Uremic Syndrome, Interstitial Nephritis
- Atypical Hemolytic-Uremic Syndrome With B Factor AnomalyAutozomálně dominantní
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Atypical Hemolytic Uremic Syndrome With Complement Gene AbnormalityAutozomálně dominantní
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Atypical Hemolytic-Uremic SyndromeAutozomálně dominantní
A rare, genetic thrombotic microangiopathy due to dysregulation of the alternative complement pathway and characterized by the triad of hemolytic anemia, thrombocytopenia, and acute renal dysfunction.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Hemolytic-Uremic Syndrome
Acute kidney injury associated with microangiopathic hemolytic anemia and thrombocytopenia.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Hereditary Hemolytic Uremic Syndrome
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je CFB uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,5 kb z 6 kb genu; 2 295 těchto bází kódují protein.
Sekvenování CFB
0Snadné
Jak obtížně se CFB sekvenuje krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Téměř všechny exony genu CFB leží v místech, kde se krátká čtení mapují čistě.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu CFB v každém typu obtížné oblasti
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řady stejné báze, na kterých čtení klouzají a které nemusí celé pokrýt. Váha 15 %.0 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, které příprava knihovny pokrývá slabě. Váha 10 %.0 %
- Referenční pokrytíMezery v referenční sestavě v okolí, kde pro čtení není sekvence, s níž by se mohla srovnat. Váha 10 %.0 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítáKaždý sloupec je podíl bází exonů genu CFB v daném typu obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, kolik každá stojí při volání krátkými čteními: 0, když žádná báze není v žádné, 100, když je každá báze ve všech.
12
pozic v CFB, kde ClinVar řadí změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
12 z nich (100 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zpracovávají.
- MHCThe major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference. (12 míst)
Celé genom pokrývá všech 6 kb genu CFB, včetně intronů, nejen 2,5 kb exonů.
ClinVar pathogenic variants (15)
The CFB variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenní 9
- Pravděpodobně patogenní 6
| Varianta | Conditions | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_001710.6(CFB):c.836A>G (p.Asp279Gly) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.967A>G (p.Lys323Glu) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.967A>C (p.Lys323Gln) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1050G>C (p.Lys350Asn) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1050G>T (p.Lys350Asn) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1099A>C (p.Ser367Arg) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1101C>G (p.Ser367Arg) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1101C>A (p.Ser367Arg) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1112A>G (p.Asp371Gly) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.856T>C (p.Phe286Leu) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.858C>G (p.Phe286Leu) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.898-2A>C (opens in a new tab) | complement factor b deficiency | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.991A>G (p.Asn331Asp) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1298T>C (p.Leu433Ser) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_001710.6(CFB):c.1363G>A (p.Val455Ile) (opens in a new tab) | atypical hemolytic-uremic syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- C3complement C3Sdílí 6 onemocnění
- CD46CD46 moleculeSdílí 6 onemocnění
- CFIcomplement factor ISdílí 6 onemocnění
- THBDthrombomodulinSdílí 6 onemocnění
- CFHcomplement factor HSdílí 5 onemocnění
- DGKEdiacylglycerol kinase epsilonSdílí 5 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 2 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 2 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s CFB
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CFB. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-18: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.18-8b139e39.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CFB: complement factor B. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/cfb
Dante Labs. Gen CFB: complement factor B [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/cfb
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů