Gen
CFTR
CF transmembrane conductance regulator
- HGNC 1884↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000001626↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 1080↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 7q31.2
- Souřadnice
- Chromozom 7: 117 480 025–117 668 665 (GRCh38)
- Exony
- 27 exonů na 188,6 kb
- Protein
- 1 480 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- MRP7, ABC35, TNR-CFTR, dJ760C5.1, CFTR/MRP
- Předchozí symboly
- CF, ABCC7
- Transkript MANE Select
- ENST00000003084.11NM_000492.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CFTR i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Cystic Fibrosis
- Autozomálně recesivní
Cystic fibrosis (CF) is a genetic disorder characterized by the production of sweat with a high salt content and mucus secretions with an abnormal viscosity.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
CFTR modulator therapies (ivacaftor, lumacaftor, elexacaftor, tezacaftor), airway clearance, pancreatic enzyme replacement, antibiotic therapy, nutritional management
Male Infertility
- Congenital bilateral absence of the vas deferens (CBAVD)
Absence of both vas deferens causing obstructive azoospermia, most often due to CFTR variants and occasionally to X-linked ADGRG2 variants.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Sperm retrieval with assisted reproduction is usually possible, and CFTR results inform carrier testing of a partner.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
CFTR a léky
Ivacaftor response
Pharmacogenomics
CFTR encodes the chloride channel that is faulty in cystic fibrosis. Ivacaftor helps some faulty channels open, so it works only for people whose CF involves specific responsive variants.
- Only relevant if you have cystic fibrosis — carrying one of these variants without a second disease-causing CFTR variant does not cause CF.
- Your CF team confirms eligibility for ivacaftor and newer CFTR modulators with clinical CFTR testing.
Alely, které report čte
- S1255Pivacaftor responsive
- S549Nivacaftor responsive
- R117Hivacaftor responsive
- S1251Nivacaftor responsive
- G551Divacaftor responsive
- G551Sivacaftor responsive
- G1244Eivacaftor responsive
- G1349Divacaftor responsive
- ivacaftor non-responsive CFTR sequenceivacaftor non-responsive
- G178Rivacaftor responsive
Výsledky, které popisuje CPIC
- ivacaftor non-responsive in CF patients
- ivacaftor responsive in CF patients
Lék Úroveň CPIC Směrnice ivacaftor A CFTR and Ivacaftor Zobrazit 1 další lék
Lék Úroveň CPIC Směrnice ataluren C Calls the ivacaftor-responsive variants from CPIC's guideline; the much longer list of variants now approved for ivacaftor and combination modulators (such as elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor) is not assessed.
Jak je CFTR uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6,1 kb z 188,6 kb genu; 4 443 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CFTR
1 203
pozic v genu CFTR, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 52 (4,3 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (52 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Celý genom pokrývá všech 188,6 kb genu CFTR, včetně intronů, nikoli jen 6,1 kb exonů.
Varianty se stránkou (369)
Varianty genu CFTR se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A455E | c.1364C>A | Exon 10 | 117 548 795 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice |
| c.489+1G>T621+1G>T | Intron 4 | 117 531 115 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.579+1G>T711+1G>T | Intron 5 | 117 534 366 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.1585-1G>A1717-1G->A | Intron 11 | 117 587 738 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.1766+1G>A1898+1G>A | Intron 13 | 117 590 440 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.2657+5G>A2789+5G>A | Intron 16 | 117 602 868 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.2988+1G>A3120+1G>A | Intron 18 | 117 606 754 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| c.3718-2477C>T3849+10kbC->T | Intron 22 | 117 639 961 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice | |
| F508del | c.1521_1523del | Exon 11 | 117 559 590 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice |
| G85E | c.254G>A | Exon 3 | 117 509 123 | Patogenní | ★★★★4 hvězdiček z 4 Klinická směrnice |
Rysy spojené s CFTR
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CFTR. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal sperm development
- Absent sperm in semen
- Absent vas deferens
- Decreased testicular size
- Male infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Obstructive azoospermia
- Absent kidney on one side
Zobrazit ještě 4 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- CPIC a PharmGKB: alely, výsledky a léky.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CFTR: CF transmembrane conductance regulator. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/cftr
Dante Labs. Gen CFTR: CF transmembrane conductance regulator [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/cftr
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů