Genas
CFTR
CF transmembrane conductance regulator
- HGNC 1884↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000001626↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 1080↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 7q31.2
- Koordinatės
- Chromosoma 7: 117 480 025–117 668 665 (GRCh38)
- Eksonai
- 27 eksonų per 188,6 kb
- Baltymas
- 1 480 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- MRP7, ABC35, TNR-CFTR, dJ760C5.1, CFTR/MRP
- Ankstesni simboliai
- CF, ABCC7
- MANE Select transkriptas
- ENST00000003084.11NM_000492.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite CFTR ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Cistinė fibrozė
- Autosominis recesyvinis
Cistinė fibrozė (CF) – genetinis sutrikimas, kuriam būdingas prakaito su dideliu druskos kiekiu ir gleivių su nenormaliu klampumu išskyrimas.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
CFTR moduliatorių terapija (ivakaftoras, lumakaftoras, eleksakaftoras, tezakaftoras), kvėpavimo takų valymas, kasos fermentų pakaitinė terapija, antibiotikų terapija, mitybos valdymas
Vyrų nevaisingumas
- Įgimtas dvipusis sėklavamzdelių (vas deferens) nebuvimas (CBAVD)
Abiejų sėklavamzdelių nebuvimas, sukeliantis obstrukcinę azoospermiją; dažniausiai tai lemia CFTR variantai, o retais atvejais – X chromosomoje esantys ADGRG2 variantai.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Paprastai įmanoma paimti spermatozoidų ir taikyti dirbtinį apvaisinimą, o CFTR rezultatai padeda atlikti partnerio nešiotojo tyrimą.
Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
CFTR ir vaistai
Ivakaftoro atsakas
Farmakogenomika
CFTR koduoja chloridų kanalą, kuris sutrinka cistine fibroze. Ivakaftoras padeda kai kuriems sutrikusiems kanalams atsiverti, todėl veikia tik žmones, kurių cistinė fibrozė susijusi su specifiniais jautriais variantais.
- Aktualu tik tuo atveju, jei sergate cistine fibroze – šių variantų nešiojimas be antro ligą sukeliančio CFTR varianto cistinės fibrozės nesukelia.
- Jūsų cistinės fibrozės gydymo komanda patvirtins, ar tinkate gydyti ivakaftoru ir naujesniais CFTR moduliatoriais, atlikdama klinikinį CFTR tyrimą.
Alelės, kurias nagrinėja ataskaita
- S1255Pivacaftor responsive
- S549Nivacaftor responsive
- R117Hivacaftor responsive
- S1251Nivacaftor responsive
- G551Divacaftor responsive
- G551Sivacaftor responsive
- G1244Eivacaftor responsive
- G1349Divacaftor responsive
- ivacaftor non-responsive CFTR sequenceivacaftor non-responsive
- G178Rivacaftor responsive
Rezultatai, kuriuos aprašo CPIC
- ivacaftor non-responsive in CF patients
- ivacaftor responsive in CF patients
Vaistas CPIC lygis Gairės ivacaftor A CFTR and Ivacaftor Rodyti dar 1 vaistą
Vaistas CPIC lygis Gairės ataluren C Nustatomi ivakaftorui jautrūs variantai pagal CPIC gairių sąrašą; ilgesnis variantų sąrašas, dabar patvirtintas ivakaftorui ir kombinuotiems moduliatoriams (pvz., elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor), nevertinamas.
Kaip išdėstytas CFTR
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 6,1 kb iš 188,6 kb geno; 4 443 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito CFTR
1 203
CFTR geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 52 (4,3 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (52 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 188,6 kb CFTR geno, įskaitant intronus, o ne tik 6,1 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (369)
Čia pateikiami CFTR variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A455E | c.1364C>A | Eksonas 10 | 117 548 795 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės |
| c.489+1G>T621+1G>T | Intronas 4 | 117 531 115 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.579+1G>T711+1G>T | Intronas 5 | 117 534 366 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.1585-1G>A1717-1G->A | Intronas 11 | 117 587 738 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.1766+1G>A1898+1G>A | Intronas 13 | 117 590 440 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.2657+5G>A2789+5G>A | Intronas 16 | 117 602 868 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.2988+1G>A3120+1G>A | Intronas 18 | 117 606 754 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| c.3718-2477C>T3849+10kbC->T | Intronas 22 | 117 639 961 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės | |
| F508del | c.1521_1523del | Eksonas 11 | 117 559 590 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės |
| G85E | c.254G>A | Eksonas 3 | 117 509 123 | Patogeninis | ★★★★4 žvaigždučių iš 4 praktikos gairės |
Savybės, susijusios su CFTR
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti CFTR, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal sperm development
- Absent sperm in semen
- Absent vas deferens
- Decreased testicular size
- Male infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Obstructive azoospermia
- Absent kidney on one side
Rodyti dar 4 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- CPIC ir PharmGKB: aleliai, rezultatai ir vaistai.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). CFTR genas: CF transmembrane conductance regulator. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/cftr
Dante Labs. CFTR genas: CF transmembrane conductance regulator [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/cftr
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites