Gén
CFTR
CF transmembrane conductance regulator
- HGNC 1884↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000001626↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 1080↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 7q31.2
- Koordináták
- 7. kromoszóma: 117 480 025–117 668 665 (GRCh38)
- Exonok
- 27 exon, összesen 188,6 kb
- Fehérje
- 1480 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- MRP7, ABC35, TNR-CFTR, dJ760C5.1, CFTR/MRP
- Korábbi jelölések
- CF, ABCC7
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000003084.11NM_000492.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a CFTR-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Cystic Fibrosis
- Autoszomális recesszív
Cystic fibrosis (CF) is a genetic disorder characterized by the production of sweat with a high salt content and mucus secretions with an abnormal viscosity.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 5 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
CFTR modulator therapies (ivacaftor, lumacaftor, elexacaftor, tezacaftor), airway clearance, pancreatic enzyme replacement, antibiotic therapy, nutritional management
Male Infertility
- Congenital bilateral absence of the vas deferens (CBAVD)
Absence of both vas deferens causing obstructive azoospermia, most often due to CFTR variants and occasionally to X-linked ADGRG2 variants.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Sperm retrieval with assisted reproduction is usually possible, and CFTR results inform carrier testing of a partner.
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
CFTR és a gyógyszerek
Ivacaftor response
Pharmacogenomics
CFTR encodes the chloride channel that is faulty in cystic fibrosis. Ivacaftor helps some faulty channels open, so it works only for people whose CF involves specific responsive variants.
- Only relevant if you have cystic fibrosis — carrying one of these variants without a second disease-causing CFTR variant does not cause CF.
- Your CF team confirms eligibility for ivacaftor and newer CFTR modulators with clinical CFTR testing.
A jelentés által olvasott allélok
- S1255Pivacaftor responsive
- S549Nivacaftor responsive
- R117Hivacaftor responsive
- S1251Nivacaftor responsive
- G551Divacaftor responsive
- G551Sivacaftor responsive
- G1244Eivacaftor responsive
- G1349Divacaftor responsive
- ivacaftor non-responsive CFTR sequenceivacaftor non-responsive
- G178Rivacaftor responsive
A CPIC által leírt eredmények
- ivacaftor non-responsive in CF patients
- ivacaftor responsive in CF patients
Gyógyszer CPIC szint Irányelv ivacaftor A CFTR and Ivacaftor Még 1 gyógyszer megjelenítése
Gyógyszer CPIC szint Irányelv ataluren C Calls the ivacaftor-responsive variants from CPIC's guideline; the much longer list of variants now approved for ivacaftor and combination modulators (such as elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor) is not assessed.
A CFTR felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 188,6 kb-jából 6,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4443 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) CFTR gént
1203
pozíció a(z) CFTR génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 52 (4,3%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (52 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
A teljes genom a CFTR gén mind a 188,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 6,1 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (369)
Az itt található, oldallal rendelkező CFTR variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A455E | c.1364C>A | 10. exon | 117 548 795 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv |
| c.489+1G>T621+1G>T | 4. intron | 117 531 115 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.579+1G>T711+1G>T | 5. intron | 117 534 366 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.1585-1G>A1717-1G->A | 11. intron | 117 587 738 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.1766+1G>A1898+1G>A | 13. intron | 117 590 440 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.2657+5G>A2789+5G>A | 16. intron | 117 602 868 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.2988+1G>A3120+1G>A | 18. intron | 117 606 754 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| c.3718-2477C>T3849+10kbC->T | 22. intron | 117 639 961 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv | |
| F508del | c.1521_1523del | 11. exon | 117 559 590 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv |
| G85E | c.254G>A | 3. exon | 117 509 123 | Patogén | ★★★★4 csillag a 4-ből gyakorlati irányelv |
A(z) CFTR génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CFTR gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal sperm development
- Absent sperm in semen
- Absent vas deferens
- Decreased testicular size
- Male infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Obstructive azoospermia
- Absent kidney on one side
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- CPIC és PharmGKB: az allélok, az eredmények és a gyógyszerek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CFTR gén: CF transmembrane conductance regulator. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cftr
Dante Labs. CFTR gén: CF transmembrane conductance regulator [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cftr
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt