Gen
CFTR
CF transmembrane conductance regulator
- HGNC 1884↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000001626↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1080↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 7q31.2
- Koordinater
- Kromosom 7: 117 480 025–117 668 665 (GRCh38)
- Exoner
- 27 exoner på 188,6 kb
- Protein
- 1 480 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- MRP7, ABC35, TNR-CFTR, dJ760C5.1, CFTR/MRP
- Tidigare symboler
- CF, ABCC7
- MANE Select-transkript
- ENST00000003084.11NM_000492.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs CFTR, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Cystisk fibros
- Autosomalt recessiv
Cystisk fibros (CF) är en genetisk sjukdom som kännetecknas av svett med högt saltinnehåll och slemsekret med onormal viskositet.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
CFTR-modulerande läkemedel (ivakaftor, lumakaftor, elexakaftor, tezakaftor), luftvägsrensning, enzymersättning i bukspottkörteln, antibiotikabehandling, näringsbehandling
Manlig infertilitet
- Medfödd bilateral avsaknad av sädesledaren (CBAVD)
Avsaknad av båda sädesledarna som orsakar obstruktiv azoospermi, oftast på grund av varianter i CFTR och ibland på grund av X-kopplade varianter i ADGRG2.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Spermieuttag med assisterad reproduktion är vanligtvis möjligt, och resultatet från CFTR används för att undersöka om din partner är bärare.
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
CFTR och läkemedel
Svar på ivakaftor
Farmakogenomik
CFTR kodar för kloridkanalen som är felaktig vid cystisk fibros. Ivakaftor hjälper vissa felaktiga kanaler att öppnas, så det fungerar endast för personer vars cystiska fibros beror på specifika svarande varianter.
- Endast relevant om du har cystisk fibros – att bära på en av dessa varianter utan en andra sjukdomsorsakande CFTR-variant orsakar inte cystisk fibros.
- Ditt CF-team bekräftar behörighet för ivakaftor och nyare CFTR-modulatorer genom kliniska CFTR-tester.
Alleler som rapporten läser
- S1255Pivacaftor responsive
- S549Nivacaftor responsive
- R117Hivacaftor responsive
- S1251Nivacaftor responsive
- G551Divacaftor responsive
- G551Sivacaftor responsive
- G1244Eivacaftor responsive
- G1349Divacaftor responsive
- ivacaftor non-responsive CFTR sequenceivacaftor non-responsive
- G178Rivacaftor responsive
Resultat som CPIC beskriver
- ivacaftor non-responsive in CF patients
- ivacaftor responsive in CF patients
Läkemedel CPIC-nivå Riktlinje ivacaftor A CFTR and Ivacaftor Visa ytterligare 1 läkemedel
Läkemedel CPIC-nivå Riktlinje ataluren C Bestämmer de ivakaftorsvarande varianterna från CPIC:s riktlinje; den betydligt längre listan över varianter som nu godkänts för ivakaftor och kombinationsmodulatorer (såsom elexakaftor/tezakaftor/ivakaftor) bedöms inte.
Så är CFTR uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6,1 kb av genens 188,6 kb, och 4 443 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest CFTR
1 203
positioner i CFTR där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
52 av dem (4,3 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (52 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 188,6 kb av CFTR, med introner inräknade, inte bara de 6,1 kb exoner.
Varianter med egen sida (369)
De CFTR-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A455E | c.1364C>A | Exon 10 | 117 548 795 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje |
| c.489+1G>T621+1G>T | Intron 4 | 117 531 115 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.579+1G>T711+1G>T | Intron 5 | 117 534 366 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.1585-1G>A1717-1G->A | Intron 11 | 117 587 738 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.1766+1G>A1898+1G>A | Intron 13 | 117 590 440 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.2657+5G>A2789+5G>A | Intron 16 | 117 602 868 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.2988+1G>A3120+1G>A | Intron 18 | 117 606 754 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| c.3718-2477C>T3849+10kbC->T | Intron 22 | 117 639 961 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje | |
| F508del | c.1521_1523del | Exon 11 | 117 559 590 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje |
| G85E | c.254G>A | Exon 3 | 117 509 123 | Patogen | ★★★★4 stjärnor av 4 klinisk riktlinje |
Egenskaper kopplade till CFTR
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CFTR kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal sperm development
- Absent sperm in semen
- Absent vas deferens
- Decreased testicular size
- Male infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Obstructive azoospermia
- Absent kidney on one side
Visa ytterligare 4 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- CPIC och PharmGKB: allelerna, resultaten och läkemedlen.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CFTR-genen: CF transmembrane conductance regulator. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cftr
Dante Labs. CFTR-genen: CF transmembrane conductance regulator [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cftr
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor