Gen
INPPL1
inositol polyphosphate phosphatase like 1
- HGNC 6080↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000165458↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 3636↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 11q13.4
- Współrzędne
- Chromosom 11: 72 224 767–72 239 147 (GRCh38)
- Eksony
- 28 eksonów na odcinku 14,4 kb
- Białko
- 1258 aminokwasów
- Znany również jako
- SHIP2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000298229.7NM_001567.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/inppl1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj INPPL1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Opsismodysplazja
- Autosomalne recesywne
Spowodowana zmianami w obu kopiach genu INPPL1, który koduje SHIP2, enzym regulujący lipid biorący udział w przekazywaniu sygnałów komórkowych. Utrata tego enzymu zaburza rozwój blaszki wzrostowej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Opieka obejmuje kontrolę układu szkieletowego i oddechowego, wsparcie ortopedyczne oraz monitorowanie stężenia fosforanów we krwi. Oboje rodzice są zazwyczaj nosicielami, dlatego zalecane są poradnictwo genetyczne oraz badania nosicielstwa u krewnych.
Budowa genu INPPL1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,8 kb z 14,4 kb genu; 3777 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie INPPL1
4Łatwy
Stopień trudności sekwencjonowania genu INPPL1 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niemal wszystkie eksony genu INPPL1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu INPPL1 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 15%.3%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.37%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu INPPL1 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
18
pozycje w INPPL1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 14,4 kb genu INPPL1, łącznie z intronami, a nie tylko 4,8 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (18)
The INPPL1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 4
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 1
- Prawdopodobnie patogenny 13
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_001567.4(INPPL1):c.2213-2A>C (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_001567.4(INPPL1):c.94_121del (p.Glu32fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.306C>G (p.Tyr102Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.939+1G>A (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.3562dup (p.Leu1188fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.24_39del (p.Gly9fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.115_128del (p.Gly39fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.518+1G>T (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.545C>A (p.Ser182Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.1184_1185dup (p.Val396fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.1933A>T (p.Lys645Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.1945C>T (p.Arg649Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.2013T>A (p.Tyr671Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.2356C>T (p.Gln786Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.2393G>A (p.Trp798Ter) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.2659G>A (p.Glu887Lys) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.3466del (p.Arg1156fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001567.4(INPPL1):c.3549_3550insA (p.Glu1184fs) (opens in a new tab) | opsismodysplasia | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
Cechy powiązane z genem INPPL1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać INPPL1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Delayed maturation of end part of long bone
- Severe platyspondyly
- Short long bone
- Abnormal bone maturation of vertebra
- Abnormal shape of end part of bone
- Abnormal vertebral body morphology
- Delayed bone maturation
- Hook-shaped collarbone
Pokaż jeszcze 18 cech
- Hypoplastic ischia
- Hypoplastic pubic bone
- Narrow chest
- Short ribs
- Small shoulder blade
- Small wings of the pelvic girdle
- Squared iliac bones
- Underdeveloped back bones
- Low muscle tone
- Advanced bone age
- Funnel chest
- Hypoplasia of the odontoid process
- Joint stiffness
- Anterior rib cupping
- Bell-shaped thorax
- Generalized decreased muscle tone
- Posterior rib cupping
- Scoliosis
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-18: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-8b139e39.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen INPPL1: inositol polyphosphate phosphatase like 1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/inppl1
Dante Labs. Gen INPPL1: inositol polyphosphate phosphatase like 1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/inppl1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni