Gen
JAK2
Janus kinase 2
- HGNC 6192↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000096968↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 3717↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 9p24.1
- Koordinater
- Kromosom 9: 4 985 272–5 129 948 (GRCh38)
- Eksoner
- 25 eksoner over 144,7 kb
- Protein
- 1 132 aminosyrer, 130,7 kDa
- Også kjent som
- JTK10
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000381652.4NM_004972.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Del denne siden
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/jak2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes JAK2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Arvelig trombocytemi (JAK2)
- Trombocytemi 3Autosomal dominant
Forårsaket av en arvelig endring i JAK2, som gir et signalprotein som styrer produksjonen av blodceller. De rapporterte endringene ligger i de delene av proteinet som styrer aktiviteten og gjør det mer aktivt, noe som øker blodplateproduksjonen. Den første som ble beskrevet, JAK2 R564Q, ble funnet i en familie med dominant arvet trombocytemi.
- GenCC 22 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsverdi
Oppfølging hos hematolog, inkludert kontroll av blodtall, siden blodkreft har forekommet i noen berørte familier. Kunnskapsgrunnlaget er begrenset, og for barn finnes det ingen enighet om retningslinjer. Fordi tilstanden arves autosomalt dominant, har hvert barn av en berørt forelder 1 av 2 sjanse for å arve endringen, og testing av slektninger kan vise hvem andre som bærer den.
Les JAK2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestSlik er JAK2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 7 kb av genets 144,7 kb, og 3 399 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av JAK2
3Lett
Hvor vanskelig JAK2 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til JAK2 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til JAK2 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.2,7 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.11 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til JAK2 i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
5
posisjoner i JAK2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helgenomsekvensering dekker alle 144,7 kb av JAK2, inkludert introner, ikke bare de 7 kb med eksoner.
ClinVar-patogene varianter (5)
Variantene i JAK2 som ClinVar klassifiserer som patogene eller sannsynlig patogene for en hvilken som helst tilstand, vurdert av minst én innsender med kriterier, samt de mest vurderte av dem. Dette er ClinVars offentlige oversikt over genet, aldri et resultat.
- Patogen 1
- Sannsynligvis patogen 4
| Variant | Tilstander | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004972.4(JAK2):c.1849G>T (p.Val617Phe) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_004972.4(JAK2):c.1691G>A (p.Arg564Gln) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.2600G>A (p.Arg867Gln) | Budd-Chiari syndrome og 5 andre | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.2813G>A (p.Arg938Gln) | thrombocythemia 3 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_004972.4(JAK2):c.3284C>T (p.Pro1095Leu) | acquired polycythemia vera | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Egenskaper knyttet til JAK2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene JAK2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Extramedullary hematopoiesis
- Increased circulating hemoglobin concentration
- Increased hematocrit
- Increased number of platelets in blood
- Myelofibrosis
- Abnormal shape of platelets
- Acute blood cancer
- Bleeding gums
Vis 36 egenskaper til
- Bleeding tendency
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bloody nose
- Bone marrow disease
- Bruising susceptibility
- Increased megakaryocyte count
- Increased red blood cells
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood clot in liver vein
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Abnormal blood clot
- Acute myeloid leukemia
- Blood clot in portal vein
- Blood spots
- Bone marrow hypercellularity
- Chronic myelogenous leukemia
- Ecchymosis
- Elevated white blood count
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Blood tumor
- Bleeding in brain
- Increased micromegakaryocyte count
- Increased red blood cell mass
- Myeloproliferative disorder
- Peripheral blood clot
- Thromboembolism
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-23: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte leser har vanskelig for å lese.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genomet, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- AlphaFold DB-modell AF-O60674-F1, versjon 6, fra Google DeepMind og EMBL-EBI (CC BY 4.0): proteinets struktur slik AlphaFold forutsier den, ikke slik den er målt, og modellens sikkerhet for hver del.
- Datautgivelse 2026.10.23-dc0c0517.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). JAK2-genet: Janus kinase 2. Hentet 24. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/jak2
Dante Labs. JAK2-genet: Janus kinase 2 [Internett]. [sitert 24. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/jak2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker