Geeni
KCNJ13
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13
- HGNC 6259↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000115474↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3769↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q37.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 232 765 802–232 776 565 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 10,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 360 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- Kir7.1, Kir1.4, LCA16
- MANE Select -transkripti
- ENST00000233826.4NM_002242.4
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj13.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue KCNJ13 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Leber-kongenitaalinen amauroosi ja RPE65-välitteinen retinopatia
- Leber-kongenitaalinen amauroosiAutosomaalinen resessiivinen
Joukko perinnöllisiä verkkokalvorappeumia, joita aiheuttavat muutokset geeneissä kuten CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 ja AIPL1. Ne aiheuttavat vakavan näönmenetyksen, nystagmuksen ja heikon pupillireaktion jo vauvaiässä.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Geenin vahvistaminen voi selvittää, soveltuuko henkilö geenikohtaisiin hoitoihin ja kliinisiin tutkimuksiin, ja se tukee myös perheen neuvontaa.
Vitreoretinopatia
- Vitreoretinaalinen degeneraatio
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: kohtalainen
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
KCNJ13-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,6 kb geenin 10,8 kb:stä; 1 083 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: KCNJ13
4
KCNJ13-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 10,8 kb geenistä KCNJ13, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 3,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneYhteinen sairaus: 1
- BEST1bestrophin 1Yhteinen sairaus: 1
- CAPN5calpain 5Yhteinen sairaus: 1
- CCT2chaperonin containing TCP1 subunit 2Yhteinen sairaus: 1
- CEP290centrosomal protein 290Yhteinen sairaus: 1
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainYhteinen sairaus: 1
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin KCNJ13 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita KCNJ13 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Clouding of the lens of the eye
- Decreased clarity of vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Corneal guttata
- Marked vision impairment
- Abnormal color vision
Näytä 34 piirrettä lisää
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Bulging cornea
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Farsightedness
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Snowflake vitreoretinal degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Undetectable electroretinogram
- Visual impairment
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Optically empty vitreous
- Outward facing eye ball
- Posterior subcapsular cataract
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Retinal dots
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). KCNJ13-geeni: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/kcnj13
Dante Labs. KCNJ13-geeni: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/kcnj13
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa