Gene
KCNJ13
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13
- HGNC 6259↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000115474↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 3769↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 2q37.1
- Coordinate
- Cromosoma 2: 232.765.802–232.776.565 (GRCh38)
- Esoni
- 3 esoni su 10,8 kb
- Proteina
- 360 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- Kir7.1, Kir1.4, LCA16
- Trascritto MANE Select
- ENST00000233826.4NM_002242.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Amaurosi congenita di Leber e retinopatia correlata a RPE65
- Amaurosi congenita di LeberAutosomica recessiva
Un gruppo di distrofie retiniche ereditarie, causate da alterazioni di geni come CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 e AIPL1, che determinano una grave perdita della vista, nistagmo e risposte pupillari ridotte già nella prima infanzia.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
La conferma del gene può determinare l'idoneità a trattamenti genospecifici e sperimentazioni cliniche, e orienta la consulenza familiare.
Vitreoretinopatia
- Degenerazione vitreoretinica
- ClinGen valuta il legame come moderato
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di KCNJ13
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,6 kb dei 10,8 kb del gene; 1083 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge KCNJ13
4
posizioni in KCNJ13 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 10,8 kb di KCNJ13, introni inclusi, non solo i 3,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneCondivide 1 condizione
- BEST1bestrophin 1Condivide 1 condizione
- CAPN5calpain 5Condivide 1 condizione
- CCT2chaperonin containing TCP1 subunit 2Condivide 1 condizione
- CEP290centrosomal protein 290Condivide 1 condizione
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainCondivide 1 condizione
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainCondivide 1 condizione
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Condivide 1 condizione
Tratti collegati a KCNJ13
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che KCNJ13 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the eye
- Clouding of the lens of the eye
- Decreased clarity of vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Corneal guttata
- Marked vision impairment
- Abnormal color vision
Mostra altri 34 tratti
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Bulging cornea
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Farsightedness
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Snowflake vitreoretinal degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Undetectable electroretinogram
- Visual impairment
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Optically empty vitreous
- Outward facing eye ball
- Posterior subcapsular cataract
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Retinal dots
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene KCNJ13: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/kcnj13
Dante Labs. Gene KCNJ13: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/kcnj13
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