Genas
KCNJ13
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13
- HGNC 6259↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000115474↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 3769↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 2q37.1
- Koordinatės
- Chromosoma 2: 232 765 802–232 776 565 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 10,8 kb
- Baltymas
- 360 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Kir7.1, Kir1.4, LCA16
- MANE Select transkriptas
- ENST00000233826.4NM_002242.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj13.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite KCNJ13 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Leberio įgimta amaurozė ir su RPE65 susijusi retinopatija
- Leberio įgimta amaurozėAutosominis recesyvinis
Paveldimų tinklainės distrofijų grupė, kurią sukelia pakitimai tokiuose genuose kaip CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 ir AIPL1. Ji sukelia smarkų regėjimo sutrikimą, nistagmą ir silpnas vyzdžių reakcijas kūdikystėje.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Patvirtinus geną, galima nustatyti, ar jūs tinkate genui specifiniam gydymui ir klinikiniams tyrimams, taip pat tai padeda šeimai priimti sprendimus dėl konsultacijų.
Vitreoretinopatija
- Vitreoretinalinė degeneracija
- ClinGen vertina ryšį kaip vidutinį
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas KCNJ13
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,6 kb iš 10,8 kb geno; 1 083 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: KCNJ13
1Maža
Kiek sunku sekti KCNJ13 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo KCNJ13 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.3,8 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.0 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
4
KCNJ13 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 10,8 kb geno KCNJ13, įskaitant intronus, o ne tik 3,6 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneTuri 1 bendrą būklę
- BEST1bestrophin 1Turi 1 bendrą būklę
- CAPN5calpain 5Turi 1 bendrą būklę
- CCT2chaperonin containing TCP1 subunit 2Turi 1 bendrą būklę
- CEP290centrosomal protein 290Turi 1 bendrą būklę
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainTuri 1 bendrą būklę
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su KCNJ13
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti KCNJ13, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Clouding of the lens of the eye
- Decreased clarity of vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Corneal guttata
- Marked vision impairment
- Abnormal color vision
Rodyti dar 34 savybių
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Bulging cornea
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Farsightedness
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Snowflake vitreoretinal degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Undetectable electroretinogram
- Visual impairment
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Optically empty vitreous
- Outward facing eye ball
- Posterior subcapsular cataract
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Retinal dots
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). KCNJ13 genas: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/kcnj13
Dante Labs. KCNJ13 genas: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/kcnj13
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites