Geeni
JAG1
jagged canonical Notch ligand 1
- HGNC 6188↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000101384↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 182↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 20p12.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 20: 10 637 684–10 673 999 (GRCh38)
- Eksonit
- 26 eksonia 36,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 218 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- AHD, AWS, HJ1, CD339
- Aiemmat symbolit
- AGS, JAGL1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000254958.10NM_000214.3
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/jag1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue JAG1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Alagillen oireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
Alagillen (AGS) oireyhtymälle on vaihtelevasti ominaista krooninen kolestaasi maksan sisäisten sappitiehyiden vähyyden vuoksi, keuhkovaltimon perifeerinen ahtauma, nikamien segmentaatiopoikkeavuudet, tyypillinen kasvojen ulkonäkö, takarajan embryotoksoni tai etusilmäkammion poikkeavuudet, pigmentoitunut retinopatia sekä dysplastiset munuaiset.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Maralixibat (Livmarli, FDA 2021) kolestaattisen kutinan hoitoon; ursodeoksikoolihappo; rasvaliukoisten vitamiinien lisähoito; maksansiirto etenevän maksan vajaatoiminnan vuoksi; sydänkirurgia monimutkaisten sydänvikojen vuoksi
Laajemmat ryhmät
Charcot-Marie-Tooth-tauti
Yksi 62 siihen liittyvästä geenistä
Ryhmä perinnöllisiä ääreishermostosairauksia, jotka aiheuttavat etenevää heikkoutta ja distaalisten lihasten surkastumista sekä tuntohäiriöitä, pääasiassa jaloissa ja käsissä.
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Geneettinen neuvonta, alatyyppikohtainen seuranta, fysioterapia, ortoosit, neurotoksisten lääkkeiden välttäminen, geenikohtaiset kliiniset tutkimukset ja siihen liittyvien piirteiden seuranta
JAG1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,9 kb geenin 36,3 kb:stä; 3 657 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: JAG1
299
kohtaa JAG1-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 36,3 kb JAG1-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä vain 5,9 kb eksoneista.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Yhteinen sairaus: 1
- CADM3cell adhesion molecule 3Yhteinen sairaus: 1
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Yhteinen sairaus: 1
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- DHX9DExH-box helicase 9Yhteinen sairaus: 1
- DNM2dynamin 2Yhteinen sairaus: 1
- DRP2dystrophin related protein 2Yhteinen sairaus: 1
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Yhteinen sairaus: 1
- EGR2early growth response 2Yhteinen sairaus: 1
- FBLN5fibulin 5Yhteinen sairaus: 1
Geeniin JAG1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita JAG1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of limbs
- Curvature of little finger
- Short fingers or toes
- Areflexia of lower limbs
- Areflexia of upper limbs
- High-arched foot
- Clubbing of fingers
- Foot drop
- Intrinsic hand muscle atrophy
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Low muscle tone
- Weakness of outermost muscles
- Butterfly vertebral arch
- First dorsal interossei muscle weakness
- Kyphoscoliosis
- Scoliosis
- Abnormality of the ribs
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). JAG1-geeni: jagged canonical Notch ligand 1. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/jag1
Dante Labs. JAG1-geeni: jagged canonical Notch ligand 1 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/jag1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa