Gen
LYST
lysosomal trafficking regulator
- HGNC 1968↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000143669↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 1130↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 1q42.3
- Koordinaten
- Chromosom 1: 235.661.041–235.866.906 (GRCh38)
- Exons
- 53 Exons über 205,9 kb
- Protein
- 3.801 Aminosäuren
- Vererbung
- Autosomal-rezessiv
- Auch bekannt als
- CHS, Mauve
- Frühere Symbole
- CHS1
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000389793.7NM_000081.4
- Locus-Typ
- gene with protein product
ReferenzgenomGRCh38hg38
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Chediak-Higashi-Syndrom
- Autosomal-rezessiv
Das Chediak-Higashi-Syndrom (CHS) ist eine seltene, schwere genetische Erkrankung, die im Allgemeinen durch partiellen okulokutanen Albinismus (OCA), schwere Immundefizienz, eine leichte Blutungsneigung, neurologische Funktionsstörungen und lymphoproliferative Erkrankungen gekennzeichnet ist. Es wurden eine klassische, früh einsetzende Form sowie eine abgeschwächte, später auftretende Form (atypisches CHS) beschrieben.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 5 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Übergeordnete Gruppen
Sonstige angeborene Immundefekte
- Inborn error of immunity
Eines von 114 Genen, die damit verknüpft sind
Erbliche Störungen des Immunsystems, die durch Veränderungen einzelner Gene verursacht werden und beeinflussen, wie der Körper Infektionen abwehrt oder Entzündungen reguliert.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 5 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Vererbung
- Autosomal-rezessiv
- Es braucht eine veränderte Kopie von jedem Elternteil. Mit nur einer sind Sie Träger und in der Regel nicht betroffen. Sind beide Elternteile Träger, besteht für jedes Kind eine Chance von eins zu vier, beide Kopien zu erben.
Aufbau von LYST
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 13,5 kb der 205,9 kb des Gens aus; 11.406 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest LYST
242
Positionen in LYST, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 205,9 kb von LYST, einschließlich der Introns, und nicht nur die 13,5 kb Exons.
Gene mit denselben Erkrankungen
- ADARadenosine deaminase RNA specificTeilt 1 Erkrankung
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseTeilt 1 Erkrankung
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 1Teilt 1 Erkrankung
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Teilt 1 Erkrankung
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorTeilt 1 Erkrankung
- BCL11BBCL11 transcription factor BTeilt 1 Erkrankung
- BLNKB cell linkerTeilt 1 Erkrankung
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6Teilt 1 Erkrankung
- BTKBruton tyrosine kinaseTeilt 1 Erkrankung
- C1QAcomplement C1q A chainTeilt 1 Erkrankung
- C1QBcomplement C1q B chainTeilt 1 Erkrankung
- C1QCcomplement C1q C chainTeilt 1 Erkrankung
Mit LYST verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die LYST verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability
- Peripheral neuropathy
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of movement
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Brain degeneration
18 weitere Merkmale anzeigen
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of the spinal cord
- Dementia
- Epilepsy
- Inability to walk
- Incoordination
- Motor polyneuropathy
- Parkinsonism
- Somatic sensory dysfunction
- Specific learning disability
- Tremor
- Decreased reflex response
- Ongoing loss of nerve cells
- Progressive peripheral neuropathy
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Giant neutrophil granules
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal leukocyte morphology
- Abnormality of coagulation
- Abnormality of multiple cell lineages in the bone marrow
- Bleeding gums
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
15 weitere Merkmale anzeigen
- Hemophagocytosis
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Vacuolated lymphocytes
- Abnormal natural killer cell morphology
- Abnormal neutrophil physiology
- Abnormal platelet function
- Bleeding tendency
- Hypofibrinogenemia
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low platelet count
- Abnormal dense granules
- Decreased blood leukocyte number
- Impaired neutrophil bactericidal activity
- Recurring nosebleed
Abnormality of the eye
- Absent pigmentation in the eye
- Abnormal retinal pigmentation
- Decreased clarity of vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Light eye color
- Rotary nystagmus
- Cross-eyed
- Horizontal nystagmus
2 weitere Merkmale anzeigen
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent infections
- Recurrent respiratory infections
- Recurrent bacterial skin infections
- Recurrent staphylococcal infections
- Recurrent streptococcal infections
- Skin rash
1 weiteres Merkmal anzeigen
Abnormality of the integument
- Loss of hair color
- Patchy lightened skin
- Silver-gray hair
- Fair skin
- Open skin sore
- Large clumps of pigment irregularly distributed along hair shaft
- Photosensitive skin
- Spotty increased pigmentation
1 weiteres Merkmal anzeigen
Laboratory abnormality
- Elevated serum ferritin
- Fever
- Decreased protein levels in blood
- Fluid around lungs
- Fluid retention
- High liver enzymes
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased plasma triglycerides
1 weiteres Merkmal anzeigen
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). LYST-Gen: lysosomal trafficking regulator. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/lyst
Dante Labs. LYST-Gen: lysosomal trafficking regulator [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/lyst
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