Gen
LYST
lysosomal trafficking regulator
- HGNC 1968↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000143669↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 1130↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 1q42.3
- Koordinatlar
- Kromozom 1: 235.661.041–235.866.906 (GRCh38)
- Eksonlar
- 205,9 kb boyunca 53 ekson
- Protein
- 3.801 amino asit
- Kalıtım
- Otozomal resesif
- Diğer adları
- CHS, Mauve
- Önceki semboller
- CHS1
- MANE Select transkripti
- ENST00000389793.7NM_000081.4
- Lokus türü
- gene with protein product
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
LYST ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Chediak-Higashi sendromu
- Otozomal resesif
Chédiak-Higashi sendromu (CHS), genellikle kısmi okülokütanöz albinizm (OCA), ağır immün yetmezlik, hafif kanama eğilimi, nörolojik işlev bozukluğu ve lenfoproliferatif bozukluk ile karakterize, nadir görülen ağır bir genetik bozukluktur. Erken başlangıçlı klasik form ile daha geç başlangıçlı, hafifletilmiş form (Atipik CHS) tanımlanmıştır.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 5 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Daha geniş gruplar
Diğer Doğuştan İmmün Yetmezlikler
- Bağışıklık yetmezliğinin kalıtsal formu
Buna bağlı 114 gen arasından biri
Tek genlerdeki değişikliklerden kaynaklanan, vücudun enfeksiyonlarla savaşma veya iltihaplanmayı düzenleme becerisini etkileyen kalıtsal bağışıklık sistemi bozuklukları.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 5 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Kalıtım
- Otozomal resesif
- Her iki ebeveynden birer değişmiş kopya gerekir. Tek bir değişmiş kopyayla taşıyıcı olursunuz ve genellikle etkilenmezsiniz; her iki ebeveyn de taşıyıcıysa, her çocuğun ikisini birden miras alma olasılığı dörtte birdir.
LYST geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 205,9 kb uzunluğunun 13,5 kb'sini oluşturur; bu bazların 11.406 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi LYST genini nasıl okur
242
LYST içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, LYST genindeki 205,9 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 13,5 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ADARadenosine deaminase RNA specific1 durumu paylaşıyor
- AICDAactivation induced cytidine deaminase1 durumu paylaşıyor
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 11 durumu paylaşıyor
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 11 durumu paylaşıyor
- BCL10BCL10 immune signaling adaptor1 durumu paylaşıyor
- BCL11BBCL11 transcription factor B1 durumu paylaşıyor
- BLNKB cell linker1 durumu paylaşıyor
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 61 durumu paylaşıyor
- BTKBruton tyrosine kinase1 durumu paylaşıyor
- C1QAcomplement C1q A chain1 durumu paylaşıyor
- C1QBcomplement C1q B chain1 durumu paylaşıyor
- C1QCcomplement C1q C chain1 durumu paylaşıyor
LYST ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, LYST geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability
- Peripheral neuropathy
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of movement
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Brain degeneration
18 özellik daha göster
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of the spinal cord
- Dementia
- Epilepsy
- Inability to walk
- Incoordination
- Motor polyneuropathy
- Parkinsonism
- Somatic sensory dysfunction
- Specific learning disability
- Tremor
- Decreased reflex response
- Ongoing loss of nerve cells
- Progressive peripheral neuropathy
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Giant neutrophil granules
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal leukocyte morphology
- Abnormality of coagulation
- Abnormality of multiple cell lineages in the bone marrow
- Bleeding gums
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
15 özellik daha göster
- Hemophagocytosis
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Vacuolated lymphocytes
- Abnormal natural killer cell morphology
- Abnormal neutrophil physiology
- Abnormal platelet function
- Bleeding tendency
- Hypofibrinogenemia
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low platelet count
- Abnormal dense granules
- Decreased blood leukocyte number
- Impaired neutrophil bactericidal activity
- Recurring nosebleed
Abnormality of the eye
- Absent pigmentation in the eye
- Abnormal retinal pigmentation
- Decreased clarity of vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Light eye color
- Rotary nystagmus
- Cross-eyed
- Horizontal nystagmus
2 özellik daha göster
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent infections
- Recurrent respiratory infections
- Recurrent bacterial skin infections
- Recurrent staphylococcal infections
- Recurrent streptococcal infections
- Skin rash
1 özellik daha göster
Abnormality of the integument
- Loss of hair color
- Patchy lightened skin
- Silver-gray hair
- Fair skin
- Open skin sore
- Large clumps of pigment irregularly distributed along hair shaft
- Photosensitive skin
- Spotty increased pigmentation
1 özellik daha göster
Laboratory abnormality
- Elevated serum ferritin
- Fever
- Decreased protein levels in blood
- Fluid around lungs
- Fluid retention
- High liver enzymes
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased plasma triglycerides
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). LYST geni: lysosomal trafficking regulator. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lyst
Dante Labs. LYST geni: lysosomal trafficking regulator [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lyst
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde