Genas
LYST
lysosomal trafficking regulator
- HGNC 1968↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000143669↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 1130↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1q42.3
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 235 661 041–235 866 906 (GRCh38)
- Eksonai
- 53 eksonų per 205,9 kb
- Baltymas
- 3 801 aminorūgštis
- Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- CHS, Mauve
- Ankstesni simboliai
- CHS1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000389793.7NM_000081.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite LYST ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Čediako–Higašio sindromas
- Autosominis recesyvinis
Čediako–Higašio sindromas (ČHS) yra retas sunkus genetinis sutrikimas, paprastai pasireiškiantis daliniu okulokutaniniu albinizmu (OKA), sunkiu imunodeficitu, lengvu kraujavimu, neurologine disfunkcija ir limfoproliferaciniu sutrikimu. Aprašytos klasikinė, ankstyvo pasireiškimo forma ir silpnesnė, vėlyvesnio pasireiškimo forma (atipinis ČHS).
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Platesnės grupės
Kiti įgimti imunodeficitai
- Įgimtas imuniteto sutrikimas
Vienas iš 114 su juo susijusių genų
Paveldimos imuninės sistemos ligos, sukeltos vienų genų pokyčių, kurios veikia tai, kaip organizmas kovoja su infekcijomis ar reguliuoja uždegimą.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas LYST
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 13,5 kb iš 205,9 kb geno; 11 406 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito LYST
242
LYST geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 205,9 kb LYST geno, įskaitant intronus, o ne tik 13,5 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ADARadenosine deaminase RNA specificTuri 1 bendrą būklę
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseTuri 1 bendrą būklę
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 1Turi 1 bendrą būklę
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Turi 1 bendrą būklę
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorTuri 1 bendrą būklę
- BCL11BBCL11 transcription factor BTuri 1 bendrą būklę
- BLNKB cell linkerTuri 1 bendrą būklę
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6Turi 1 bendrą būklę
- BTKBruton tyrosine kinaseTuri 1 bendrą būklę
- C1QAcomplement C1q A chainTuri 1 bendrą būklę
- C1QBcomplement C1q B chainTuri 1 bendrą būklę
- C1QCcomplement C1q C chainTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su LYST
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti LYST, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability
- Peripheral neuropathy
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of movement
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Brain degeneration
Rodyti dar 18 savybių
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of the spinal cord
- Dementia
- Epilepsy
- Inability to walk
- Incoordination
- Motor polyneuropathy
- Parkinsonism
- Somatic sensory dysfunction
- Specific learning disability
- Tremor
- Decreased reflex response
- Ongoing loss of nerve cells
- Progressive peripheral neuropathy
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Giant neutrophil granules
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal leukocyte morphology
- Abnormality of coagulation
- Abnormality of multiple cell lineages in the bone marrow
- Bleeding gums
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
Rodyti dar 15 savybių
- Hemophagocytosis
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Vacuolated lymphocytes
- Abnormal natural killer cell morphology
- Abnormal neutrophil physiology
- Abnormal platelet function
- Bleeding tendency
- Hypofibrinogenemia
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low platelet count
- Abnormal dense granules
- Decreased blood leukocyte number
- Impaired neutrophil bactericidal activity
- Recurring nosebleed
Abnormality of the eye
- Absent pigmentation in the eye
- Abnormal retinal pigmentation
- Decreased clarity of vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Light eye color
- Rotary nystagmus
- Cross-eyed
- Horizontal nystagmus
Rodyti dar 2 savybių
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent infections
- Recurrent respiratory infections
- Recurrent bacterial skin infections
- Recurrent staphylococcal infections
- Recurrent streptococcal infections
- Skin rash
Rodyti dar 1 savybę
Abnormality of the integument
- Loss of hair color
- Patchy lightened skin
- Silver-gray hair
- Fair skin
- Open skin sore
- Large clumps of pigment irregularly distributed along hair shaft
- Photosensitive skin
- Spotty increased pigmentation
Rodyti dar 1 savybę
Laboratory abnormality
- Elevated serum ferritin
- Fever
- Decreased protein levels in blood
- Fluid around lungs
- Fluid retention
- High liver enzymes
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased plasma triglycerides
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). LYST genas: lysosomal trafficking regulator. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/lyst
Dante Labs. LYST genas: lysosomal trafficking regulator [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/lyst
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites